トポロジカル極性表面積は計算コストの低い推定PSA化合物の性質を表す指標として様々な「記述子」が開発されてきたことを「RDKitにおける記述子の扱い方をリピンスキーの法則を通して学ぶ」という記事で説明しました．今回とりあげる極性表面積（PSA）も，分子記述子の１つになります． この記事ではPSAの定義と計算法から，トロポジカルPSAというPSAを低コスト計算で推定したものを紹介します．PSAとTPSAはほとんど同じものとして扱われがちですが，その歴史的背景や特徴を知っておくことで，実際に運用していく際に役立つ場面があると思います． トポロジカル極性表面積のオリジナル文献は次の論文になります．参考にしてください．「Fast Calculation of Molecular Polar Surface Area as a Sum of Fragment-Based Contributions and Its Application to th
py3Dmolを使って化学構造をJupyter上で美しく表示する
