stan推定後の可視化について Tokyo.R#94stan推定後の可視化に便利なパッケージとその関数について紹介します。 ・stanfitオブジェクトについて ・rstanパッケージの関数 ・bayesplotパッケージの関数 ・tidyverseでstanfitを扱う
Stanコードの書き方 中級編
広島ベイズ塾夏合宿で発表したStanコードの書き方中級編です。 回帰分析から，一般化線形モデル，欠損値のあるモデル，潜在変数があるモデル，ゼロ過剰分布，混合分布モデルを扱いました。Read less
Pythonで実装する「RとStanではじめるベイズ統計モデリングによるデータ分析入門」 - Qiita
Pythonで実装するベイズ統計モデリング 「RとStanではじめるベイズ統計モデリングによるデータ分析入門」はアヒル本よりも手軽にベイズ推定の実装に入門できる書籍です。 アヒル本は統計モデルの座学的章がありますが、こちらはほとんどありません。 まずはやってみよう、というところから入る本です。 また、階層ベイズについての考え方は、アヒル本と合わせて読むことでより理解が深まるかもしれません。 何故Pythonで実装するのか オフィシャルではこちらもRで実装があります。 最近はPythonを使う方が多いので、アヒル本だけでなくこちらもPythonで実装してみました。 コード PythoとPyStanで実装しています。 Github 何かありましたらプルリクエストをいただけると助かります。 点推定だけでなく、ベイズ推定も一般的に広まっていくといいのかな、と個人的に思っています。
Pystanのインストール（anaconda環境） - Qiita
インストール環境 Win10 pro 64 bit Anaconda環境 (conda4.7) リポジトリconda-forgeの追加 anacondaでは、conda とpipのインストールが混在すると環境が壊れることがあります。 condaとpip：混ぜるな危険 Jupyter Notebookが起動しないと思ったらAnaconda環境が壊れていた ですので、できるだけcondaだけでインストールしたほうが良いです。 conda-forgeは、github上のコミュニティ主体のパッケージコレクションで、たくさんのパッケージを公開しており、condaのdefaultsでは見つからないパッケージをダウンロードすることが可能です。 condaのパッケージ参照リポジトリにconda-forgeをリポジトリ先に加えることがおすすめです。 condaが探すリポジトリ先を変更する方法(conda-f
階層ベイズと状態空間モデルで広告効果を推定したい - 統計コンサルの議事メモ
背景 これまでMarketing Mix Modeling（MMM）におけるAdStock効果の推定について色々と記事を書いてきましたが、その他にも試したいと思っているモデルがいくつかあります。その一つが階層ベイズモデルと状態空間モデルを同時に取り扱うものです。 例えば「地域別の売上推移のデータ」が手元にあると考えてみましょう。地域ではなく人や商品でも構いませんが、ある要因の各水準がそれぞれ時系列データを持っている状況（いわゆるパネルデータ）で、ひとまずここでは地域とします。このようなデータはあらゆる会社で保有していることでしょう。 今、各地域についてMMMにより広告効果を推定することを考えたとき、どのようなモデリングが可能でしょうか？ シンプルに考えれば、地域ごとに一つずつモデルを作るという方法が挙げられます。例えば地域の数が2つ3つしかなかったり、モデルの作成に時間をかけることが可能で
MCMCサンプルの使い方 ～見る・決める・探す・発生させる～
2. 本資料の位置づけ • 拙著『StanとRでベイズ統計モデリング』 において, 書ききれなかったことはいくつかあります. • その中で心理学において有用そうな話題を著者な りに考えて選びました. • スライド中に出てくる章・節・図番号は その書籍内のものを指します. 2 3. 本スライドの記法 • 見やすさのため, 変数を太文字にしている. • 𝒂, 𝑿, 𝒀など. • ベクトル（出てこないけど）は書籍と同じ 𝒀 で表す. • 僕の視力の悪さに由来する. • これから推定されるパラメータを赤い文字で表す. • 𝒂, 𝝁 など. • 事後分布は 𝒑 𝒂, 𝒃, 𝝈|𝑿, 𝒀 のように書くのではなく, 見やすさのため, データを省略し, パラメータを青い文 字で表す. • 𝒑 𝒂, 𝒃, 𝝈 など. 3
「StanとRでベイズ統計モデリング」松浦健太郎 という本を書きました - StatModeling Memorandum
僕が筆者なので、この記事は書評ではなく紹介になります。まずこの本はRのシリーズの一冊にもかかわらずStanという統計モデリングのためのプログラミング言語の方がメインです。このようなわがままを許してくれた、ゆるいふところの深い石田先生と共立出版には感謝しかありません。 StanとRでベイズ統計モデリング (Wonderful R) 作者:健太郎, 松浦発売日: 2016/10/25メディア: 単行本 目次と概要 共立出版のページを見てください。GitHubのリポジトリもあります。 前提とする知識 「はじめに」の部分で触れていますが、確率と統計の基本的な知識はある方、R（やPython）で簡単なデータ加工や作図が一通りできる方を想定しています。そのため、確率分布なんて聞いたことがない、プログラミングがはじめて、Rがはじめて、という方が読み進めるのは厳しいかもしれません。なお、Rの基本的な関数し
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