Common Workflow Language入門 – 大阪大学医学部 Python会HPは移行しました
Neurokernel
What Is It? The Neurokernel Project aims to build an open software platform for the emulation of the entire brain of the fruit fly Drosophila melanogaster on multiple Graphics Processing Units (GPUs). Spotlights! Fruit Fly Brain Hackathon 2019 will be held at Columbia University on March 20, 2019. Please see the Event page for more details. The Fruit Fly Brain Observatory, a sister project of Neur
Python for Biologists
Welcome to Python for biologists Here you'll find resources for learning to program in Python for people with a background in biology Now published: Biological Data Exploration. A complete guide to cleaning, manipulating and visualizing complex biological datasets with Python. If you're looking for the exercise files for any of my books, click here. If you want to get started with writing Python c
ランダー・グリーン アルゴリズム（１） - aggren0xの日記
お気に入り経由で以下の記事を読んでとてもおもしろかったのですが、 http://ama.an-pan-man.com/archives/814 原文も読んで確認もしたんですけど、エリック・ランダーが自己紹介するにあたって「ランダー・グリーンアルゴリズム*1」について一言も触れてない。 これはとても美しいアルゴリズムで、隠れマルコフモデルの遺伝家系データへの適用で、最初にこれを思いついたのは天才だと私は思う。今でもこのアルゴリズムは応用されており、たとえば次世代シーケンサーのデータにおいても行われるハプロタイプの相決定や、imputationアルゴリズムと言ってヒトゲノム上数十万のマーカーデータから、相関構造を利用して一千万以上のマーカーデータを推定するというのに使われます。 わたしは数学出身ではありません。EMアルゴリズムのDempster論文も、なんとか読み終えることは出来ましたというレ
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Simple RNA folding in 130 lines of Haskell – Michael J. Flynn's Blog
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The myths of bioinformatics software
A science fiction story about the future of bioinformatics research
k-mer counting in a high-level language?
