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pythonとcytoscapeに関するMarukosuのブックマーク (1)

  • PythonとCytoScapeを使ってクラスタリングと可視化 - Qiita

    概要 クラスタリングは簡易であり,有益な結果を得やすいデータ分析の手法です. もともとネットワーク構造のであるデータはもちろんのこと,ネットワーク構造でないデータに関しても距離関数を定義することでネットワーク化し,クラスタリングをすることができます. このエントリではクラスタリングを行い,その結果を可視化する方法について紹介します. ネットワークとは そもそもネットワーク構造とはなんでしょうか? 一般的にはノードとエッジから構成されるデータのことであり, エッジには方向がついていたりついていなかったりします 方向があるものを有向グラフ, ないものを無向グラフといいます. エッジに重みがあるものもないものもあり,あるものを重み付きグラフといいます. クラスタリングとは データの集合をいくつかのまとまり(部分集合)に分けることです それぞれの部分集合がある共通の特徴を持つように分けます ネット

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