WebStorm の設定、例えばショートカットキーやエディター画面の色、等を Git で管理して、保存、参照することができます。現在の最新版、WebStorm 2017.1 には必要なプラグインが最初から入っています。 同期といってもローカルの設定を変更した場合に、それがリモートのリポジトリに勝手に反映されるのではないようです。ローカルでの変更をリモートのリポジトリに反映させたい場合には、File → Setting Repository から Overwrite Remote してあげればいいようです。 なので運用としては、常にローカルの設定をリモートと同期させておいて、ローカルで設定変更をしたら、それをリモートにプッシュ。でいいのではないでしょうか。 https://www.jetbrains.com/help/webstorm/2017.1/settings-repository.h