次世代遺伝子発現目次 AOE を公開しました ｜ DBCLS

DBCLS では、データベースを日々利用する研究者にその価値を届けるためにウェブサービスやコンテンツの充実を図っています。これまで DBCLS では、遺伝子発現バンク(GEO)目次としてNCBIで維持されている遺伝子発現データベース GEO (Gene Expression Omnibus) を簡単に使うインターフェースを提供してきました。一方、EBI (European Bioinformatics Institute) でも遺伝子発現データベース ArrayExpress (http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/) が維持され、GEO のデータが順次取り込まれてきた結果、ArrayExpress の方が GEO よりもデータ数が多くなっています。その現状を鑑み、遺伝子発現目次のソースとしてこちらを使うことを DBCLS では検討してきました。 この度新規に

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NGSによるRNAseqデータも明に考慮した「次世代」遺伝子発現目次AOE(あおい)を公開しました #DBCLS #DDBJ