MtDNA Position Conversions - SNPedia
The most widely used mtDNA reference sequence in use at this writing is the Revised Cambridge Reference Sequence (rCRS), and is the reference sequence for the human genome build 37 reference. The newer Reconstructed Sapiens Reference Sequence (RSRS) is expected to become the preferred reference sequence, as it is a psuedo-sequence representing what is assumed the earliest human's mtDNA sequence wo
Existing Workflow systems
Please add new entries at the bottom. In addition to this list, actively developed free/open-source systems should be registered at https://workflows.community/systems See also: https://github.com/pditommaso/awesome-pipeline Arvados - CWL-based distributed computing platform for data analysis on massive data sets. https://arvados.org/ https://github.com/arvados/arvados Apache Taverna http://www.ta
Cloudera、ブロード研究所と次世代ゲノム解析ツールキットを開発
Cloudera、ブロード研究所と次世代ゲノム解析ツールキットを開発Apache Sparkを使用しCloudera Enterprise上でバイオインフォマティクス（生物情報学）の スタンダードとして、ゲノム研究の促進に向けデザインされたGATK4を開発 2016年4月6日 米国カリフォルニア州パロアルト発 － Apache Hadoopと最新のオープンソーステクノロジーをベースに、最も高速で最も使いやすく、セキュアなデータ管理と分析を実現するプラットフォームを提供するClouderaは、本日、生物医学とゲノム研究の世界最先端をいくマサチューセッツ工科大およびハーバード大の研究施設のブロード研究所との協業を発表しました。２つの組織は、次世代のゲノム解析ツールキット“GATK4"の開発を推進するために、今年度共同で作業を行います。 Cloudera Enterpriseは、臨床医や研究者お
Three ways to trim adaptor/primer sequences for paired-end reads
My learning notes for R, Unix, Perl, statistics, tools/resources, biology etc. everything about Bioinformatics 1. Understanding the adaptors (skip this part if you're familiar with the Illumina adaptor) Before trimming anything from the reads, let's get clear what the reads content is. Taking Trufseq reads (from Illumina HiSeq 2000) as example, here is the read file (fastq) looks like: $ cat r1.fq
Custom servers for BLAST search for your team and data
Researchers and staff scientists in hundreds of companies and labs use SequenceServer to BLAST their nucleotide and amino-acid sequences. We've been cited 250 times. Applications range from vaccine development to cancer research, molecular diagnostics, synthetic biology, metagenomics, barcoding, evolutionary genomics and tracking illegal ivory seizures. SequenceServer is the best way to BLAST cust
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クレジットカード現金化とは？その仕組み そもそもクレジットカードの現金化とは、ショッピング枠で商品を購入し、業者からキャッシュバックなどで現金を得る行為のことを指します。 クレジットカードには、商品やサービスを購入し、後払いにする「ショッピング」の機能と、お金を借り入れる「キャッシング」の機能があり、それぞれに利用できる金額が設定されています。 「クレジットカードショッピング枠の現金化」とは、本来、商品やサービスを後払いするために設定されている「ショッピング」の利用可能枠を換金する目的で利用することです。 引用：一般社団法人日本クレジット協会 クレジットカード現金化の仕組みについても知っておきましょう。 自分で現金化をする場合でも、基本的に同じ仕組みです。
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LeafCutter vs. MAJIQ and comparing differential splicing algorithms
GitHub - pbnjay/lollipops: This is the development fork - Stable code has been moved to ==>
Improving genetic diagnosis in Mendelian disease with transcriptome sequencing – a walk through
rCRS vs. RSRS vs. HG19 (Yoruba) | Haplogrep
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