週報 2024/04/28 川はただ流れている 4/20(土) 初期値依存性 さいきん土曜日は寝てばかり。平日で何か消耗しているらしい。やったことと言えば庭いじりと読書くらい。 ベランダの大改造をした。 サンドイッチ 一年前に引っ越してからこんな配置だったのだけど、さいきん鉢を増やしたら洗濯担当大臣の妻氏…
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僕はバイオインフォマティクスの会社に勤めているんですけど、統計関係の仕事をしています*1。 なので、たまにバイオの人から統計関係の相談を持ちかけられることがあります。 今回、ちょっとおもしろいことを相談されて、頭を悩ませたので、ここで紹介しようと思います。 RNA-Seq v.s. マイクロアレイ 今回相談されたことというのは、RNA-Seq の解析結果とマイクロアレイの解析結果で、同じような結果が出たのかどうか知りたいが、どうすればいいか?というものでした。 もう少し詳しく言うと、同じ組織に対して RNA-Seq とマイクロアレイで発現変動を調査したところ、RNA-Seq で変動がみられた遺伝子が 4000 個、マイクロアレイで変動がみられた遺伝子が 1000 個、両方で共通して変動がみられた遺伝子が 300 個だったそうです。 このとき、300 個というのは多いのか少ないのか、RNA-
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