RNA-Seq とマイクロアレイでの変動遺伝子の比較方法について（１） - ほくそ笑む僕はバイオインフォマティクスの会社に勤めているんですけど、統計関係の仕事をしています*1。 なので、たまにバイオの人から統計関係の相談を持ちかけられることがあります。 今回、ちょっとおもしろいことを相談されて、頭を悩ませたので、ここで紹介しようと思います。 RNA-Seq v.s. マイクロアレイ 今回相談されたことというのは、RNA-Seq の解析結果とマイクロアレイの解析結果で、同じような結果が出たのかどうか知りたいが、どうすればいいか？というものでした。 もう少し詳しく言うと、同じ組織に対して RNA-Seq とマイクロアレイで発現変動を調査したところ、RNA-Seq で変動がみられた遺伝子が 4000 個、マイクロアレイで変動がみられた遺伝子が 1000 個、両方で共通して変動がみられた遺伝子が 300 個だったそうです。 このとき、300 個というのは多いのか少ないのか、RNA-
