ブログエディタ「ecto」にハマる（いい意味で）
【お知らせ】 新ブログ開設しました。 ショートカット導入しました。「N」で次のエントリー、「P」で前のエントリー、「M」でメインページ表示、「B」ではてなブックマーク該当ページを表示します StartMacモニター当初から、いや実際にはMacなど触ったことのない第1回ブログ合宿の頃から、ネタフルの中に人に「いいですよ」とお勧めされてきたブログエディタ「ecto」。当初はMacに慣れるのが精一杯で「そのうち入れますよー」なんて答え返してたんですけど、ブラウザやメールなどは一通り使えるようになってきたのと、Safariが激しく落ちるようになってきてブラウザでブログ書くのが怖くなり、「さてそろそろ試してみるか」とインストールしてみました。 ecto http://ecto.kung-foo.tv/ いやもうね、正直すまんかった。ectoすばらしすぎ！ これ激しくブログ書くのに便利！ というわけで
Macでバイオインフォマティクス
use Bio::DB::Fastaを使って、FASTAファイル中から指定したIDの配列をFASTA形式で出力させます。 サンプルではスクリーン出力にしてあります。 #!/usr/bin/perl use Bio::SeqIO; use Bio::DB::Fasta; #スクリーンに出力 $seq_out = Bio::SeqIO->new(-fh => \*STDOUT, '-format' => 'fasta'); $file = "sample.fasta"; $id = $ARGV[0]; $db = Bio::DB::Fasta->new($file); $seqobj = $db->get_Seq_by_id($id); $seq_out->write_seq($seqobj); ClustalWで大量の配列のアライメントをしようと思うと、かなりの時間がかかりますが、FastA
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