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algorithmとDNARNAに関するHashのブックマーク (1)

  • RNA二次構造の予測アルゴリズム

    RNAの二次構造,タンパクの二次構造,遺伝子の構造など,原理的には観察することが可能であったとしても,そのためには経済的,時間的コストがかかります.そこで,配列に基づいてこれらの構造を予測する手法が開発されています. 分子生物学におけるRNAの重要性が強く認識されるようになっています.セントラルドグマに直接に関わるrRNA, mRNA, tRNAだけでなく,ncRNA(non-coding RNA; タンパクではないが機能をもつRNA),RNA editingやRNAiが様々な生命現象に関わっていることが示唆されています. [練習] RNAファミリーのデータベースRfamで興味のあるRNAを探してみましょう. RNAの二次構造は,相補的な塩基のペアであるAU, GC,もしくはGUが水素結合により対合することにより形成されます.それらの構造は,A: hairpin loop, B: inte

    Hash
    Hash 2008/05/23
    RNAの二次構造予測アルゴリズム。詳細な解説日本語。おもろい。Ts氏が使ってた"MFOLD"は->http://frontend.bioinfo.rpi.edu/applications/mfold/cgi-bin/rna-form1.cgi
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