マイクロアレイデータにおける発現変動遺伝子の定義 (1) – 遺伝子発現解析（マイクロアレイ解析, RNA-seq）

コントロールのシグナル値が100であるのに対して、サンプルのシグナル値は200です。直感的にサンプルのほうが高いことが分かります。どれくらい大きいかを議論するには、「差」を用いる方法と、「比」（何倍か）を用いる方法があります。マイクロアレイデータでは、「比」を用いることが多いです。この場合、比＝サンプル／コントロールを計算します。結果は、200/100 = 2 となります。つまり、遺伝子Aに関して、サンプルのシグナル値はコントロールの2倍に上がっていることになります。「比」は、ratio または fold-change と表記されます。 では、何倍に上がっていれば（下がっていれば）、発現変動遺伝子といえるのでしょうか？ 多くの研究者にとって、マイクロアレイ解析に期待するのは、「どの遺伝子の発現が上がっていて、どの遺伝子の発現が下がっているのか」ということだと思います。つまり、どれが発現変動