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MiSeqのデータセット
このページの、右上あたりにある、Download the data から、FastqファイルとBAMファイルが落とせます。... このページの、右上あたりにある、Download the data から、FastqファイルとBAMファイルが落とせます。 E.coliのデータです。 サイズが大きく、ダウンロードに結構時間がかかるので、wget で取得すると良いと思います。 (wget http://.........ファイルのURL............) ついでに、というかこっちの方が面白いかもしれませんが、BAMファイルの下の、プレゼンテーションファイルも落として見てみましょう。 びっくりしますが、スライドの後半部分に、MiSeqデータとIon Torrent PGMデータの比較、があるのです! ここから先は実際にダウンロードしてからのお楽しみ? 当たり前ですが、MiSeqの方がいい! と結論しています。 カバレージで言うと、1ランで1.7Gb読めるMiSeqは、393x 一方PGMは6~8ラン読んでも11~24