遺伝子系統樹構築法概要

核酸配列のまま解析するかアミノ酸に翻訳して解析するか 非常に近縁な配列を解析する場合には核酸配列をそのまま解析する。 一定以上離れている解析を行う場合はアミノ酸配列に翻訳してから解析する。 プログラムの準備 本ページではMac OS X上で実行する例を示してあるが、 大抵のUNIXシステムで行うことができるはずである。 その場合、UNIXにログインする方法と UNIXとファイルのやり取りする方法については サイトごとに異るので管理者に聞いてもらいたい。 準備として、開発環境の導入 とMOLPHY, MAFFT, Clustalwのコンパイルと導入を行う。 MOLPHY、MAFFT、 およびClustalWは大抵のUNIXシステムで、 コンパイル・実行可能である。少なくとも、 FreeBSD 4.1-RELEASE, IRIX6.5, SunOS 5.6, Mac OS X Public B