超並列分子動力学計算ソフトウェア「GENESIS」を開発 | 理化学研究所
要旨 理化学研究所（理研）計算科学研究機構粒子系生物物理研究チームの杉田有治チームリーダー、ジェウン・ジョン研究員、杉田理論分子科学研究室の森貴治研究員らの共同研究チーム※は、生体分子の運動を１分子レベルから細胞レベルまでの幅広い空間スケールで解析可能なシミュレーションソフトウェア「GENESIS」を開発し、5月8日からオープンソースソフトウェアとして無償で公開します。 近年、計算機によるシミュレーションは、実験、理論に次ぐ第3の解析手法として、さまざまな分野で活用されています。生命科学では分子動力学法[1]と呼ばれるシミュレーション技法が、タンパク質の立体構造予測や、酵素反応のメカニズムの解明、薬の理論設計などに広く応用されています。分子動力学法は粒子間相互作用[2]をクーロンの法則などの物理法則に基づいて計算し、ニュートンの運動方程式F = maを解くことで分子の動きをコンピュータ内で
経験による脳回路の変化を新モデルで予測 | 理化学研究所
ポイント 既存のモデルでは、経験による脳回路の変化を説明できないことを確認 2種類の可塑性とそれに関わる分子メカニズムを再現する理論モデルを確立 理論モデルから新しい仮説を立て、それを生理実験により実証 要旨 理化学研究所（理研、野依良治理事長）は、経験による脳回路の変化を担っている時間スケールの異なる2種類のメカニズム（可塑性[1]）が、相互に調節し合いながら働く仕組みを組み込んだ新しい理論モデルを確立しました。これは、理研脳科学総合研究センター（利根川進センター長）神経適応理論研究チームの豊泉太郎チームリーダーと、米国コロンビア大学理論神経科学センター、同大学カブリ脳科学研究所のケニス・ミラー教授、およびカリフォルニア大学サンフランシスコ校の金子めぐみ研究員、マイケル・ストライカー教授らによる共同研究グループの成果です。 私たちが経験を通じて学習できるのは、脳回路内の神経細胞同士のつな
もう1つの現実を体験する「代替現実システム」を開発 | 理化学研究所
ポイント 記録・編集済みの過去を目の前で実際に起きている現実として体験させるシステム 従来の実験法ではできなかったさまざまな認知心理実験が可能に VRや拡張現実とは異なる、新しいヒューマンインターフェースの展開に期待 要旨 理化学研究所（野依良治理事長）は、バーチャルリアリティー（VR）※1に用いられてきた技術を応用し、予め用意された「過去」の世界を「現実」と差し替え、被験者に過去を現実と区別無く体験させる実験装置「代替現実システム（Substitutional Reality System＝SRシステム）」を開発しました。これは理研脳科学総合研究センター（利根川進センター長）適応知性研究チームの藤井直敬チームリーダーと、脇坂崇平研究員、鈴木啓介研究員（現イギリス サセックス大学研究員）の研究成果です。 私たちの脳は、目の前に広がる“現実”は確かなものであると強く信じています。つじつまの合
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