吾輩はキリンである．模様はひび割れている
細胞工学連載コラム「生命科学の明日はどっちだ？」目次 吾輩はキリンである．模様はひび割れている 皆さま，申し訳ありません．ジンクピリチオン祭りで燃え尽きてしまい，2カ月ほどお休みをいただきました．今月号からまたよろしくお願いいたします． 寺田寅彦を知ってますか？ 今回もちょっと古い話で始まります．図1 の切手の肖像が誰だかわかるでしょうか？ 若い人はたぶんご存知ないかもしれないが，この人物が今回の主役の物理学者，寺田寅彦（1878 ～ 1935）である．一見，何の変哲もない硬物の昔のおっさんだが，これがまたつはたいしたおっさんなのである．大体，この切手の写真にしたって，じつは下の写真のような「きれいどころ」に囲まれて，にやけるのをこらえている一枚なのである．こんな写真が切手になるところからしてただものではないが，科学的な業績は，もっとすごい． 寅彦は，X線結晶解析に関して非常に先駆
Debug in R #6: Debug in S4/R5 classes
S4/R5クラスのデバッグ Rにビルトインされたオブジェクト指向的なフレームワークを提供する仕組みとして、S3以外に、S4とR5がある。大規模なパッケージを作るときとか、mutableな機能を実装するときにはとても役立つ。 あとR5はR5 reference classというように、参照渡しのセマンティックで実装されてるので、関数型言語らしさはなくなっちゃうんだけど、馬鹿でかいデータとかある時にはコピーが発生しないので、効率がよくなるはず。 ここらへんを使ってる人は、特に説明もいらないと思うので、デバッグのやり方は以下の実例で。ポイントだけ箇条書きします。 S4の場合、traceにsignatureを渡す。 S4の場合、特定のインスタンスのメソッドだけデバッグする、というのは難しい(相当回りくどいことしないと無理だと思う)。 R5の場合、生成されたインスタンスのメソッドに対して普通の関数の
R5 reference class覚え書き - はやしのブログ Rev.3
R2.12から実装されたR5クラスの覚え書きです。日本語の情報はまだないみたいなので一番乗りを狙って。ちなみに継承関係は、面倒なので完全に無視してます。ごめんなさい。その他、網羅性は期待しないでください。 R5クラスの特徴 参照渡し オブジェクトを編集できる S4より緩くて使いやすい 他にもあると思いますが、触ってみた感想ということで。 とりあえずクラス定義 tc <- setRefClass(Class="testClass", fields = list(f1="numeric", f2="numeric"), methods = list( foo = function() { "f1とf2を足し合わせるメソッド" f1 + f2 })) R5クラスはsetRefClass()で定義します。主に使うオプションは、Classとfieldsとmethodsです。Classでクラス名を定義
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