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ブックマーク / qiita.com/Yh_Taguchi (1)

  • Enformerの紹介 - Qiita

    #はじめに DeepLearningを使ったバイオインフォマティクス分野のキラーアプリというとAlphaFold2が一世を風靡していますが、AlphaFold2を作ったDeepMind社が同じく作成したEnformerというアプリ、当然ながらDeepLearningを使っているわけですが、AlphaFold2に比べるとほどんどガン無視な状態です。この記事ではそんな可哀そうなEnformerについて解説したいと思います。 #Enformerって何? 一言でいうと「BERTの入力にゲノムの塩基配列を使ったもの」ということになります(以下では基的にBERTの内容は理解できているという前提で書いていますのでBERTのアーキテクチャーが解ってないという人はまずはBERTを勉強してから読んで下さい)。実のところただこれだけだったら先行研究もありDNABERTなどもそれにあたります。じゃあ、Enfor

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