とあるRubyをやめた理由（BioRuby編）南極寿星 (Canopus) @nankyokujusei 【わたしが Ruby をやめた理由】Linux で ちゃんと動く gem が、Leopard / Snow leopard では動かなかった。 2012-03-07 08:46:49
Rubyが切り開く科学の未来 - ほげほげにゃ
この記事はRuby Advent Calendar 2014の13日目の記事です。 初めに Rubyを教育・研究に使おうという試みはRubyの黎明期からありました。 この時期の有名なパッケージとしてはバイオインフォマティクスのBioRubyや地球科学の電脳Rubyプロジェクトが有名です。 先述のBioRubyやGPhys(電脳Rubyの成果物)は現在も更新が続けられており、多数の利用者を抱えています。 しかし全体として見た場合、科学の分野で使われるLL言語としてRubyはPythonやRの後塵を拝している印象があります。 科学計算における均質化、あるいはなぜPythonが着実に他言語のシェアを奪っているか 記事のようにこの分野ではPythonコミュニティが非常に活発で、機械学習など新しい技術は真っ先にPythonで実装されるようになっています。 しかし最近Rubyでも少しずつですが環境が充
バイオ研究者見習い生活 with ITを通じて感じたこと、ぼくなりのまとめ。 - 終始一誠意
あの記事からもう2週間かぁ。この記事をきっかけにwet研究への付き合い方を考えはじめるようになった。 wetの研究は自然の真理を探究するという点で帰納的な研究が大前提となる。答えは自然（神と置き換えてもいいが）しか知らないわけで、権力は自然側が持っており人間は常にねじ伏せられる側にある。 どんな秩序だった仮説を立てようとも、方向性が違えばいくら研究しても答えにはたどり着けない。「仮説の証明」という最終目標はあるが、その仮説が「真」か「偽」か曖昧模糊な状態で、Wetの研究に邁進せねばいけないという点で、Wet研究者は苦しい。砂上の楼閣というか、今までの研究が足元から崩れる可能性がいつ起こってもおかしくない。しかし、土台の土台（例えば遺伝物質は核酸である、とか）を疑ってかかるほど時間も無いから盲目的に信じるしかない。こういう点で「宗教」と同類であると僕は思う。厳密性の程度の差しかないのではない
Ruby for Science
Ruby for Scientific Computing Rubyで科学計算する例の紹介です。事例追加をお待ちしています。 カテゴリは後で調整するかもしれません。-masa *1 *2 *3 *4 *5 Ruby科学計算関連総合 SciRuby - Since June 2005, by Ara T. Howard. るびま0006 Ruby Library Report [第5回] 数値計算と可視化 - 著者： 堀之内 武 各分野での利用 Mathmatics - 数学 Algebra - 計算代数 Polynominal - by 児玉さん Algebra - by 原さん - 多変数多項式環のグレブナ−基底の実装。 Ruby Mathematica - MathematicaへのRubyインタフェース。 「プログラミングのための線形代数」 - 平岡和幸著 Earth Science
Biohackathon 2008 の開催のお知らせ - 研究開発創作日誌
2008-02-11から15まで、東京で BioHackathon 2008 が開催されます。 Web Service BioHackathon 2008 のご案内 Web Service Hackathon 開催趣旨 国内外から（１）バイオ系ウェブサービス提供サイト開発者、（２）Open Bio*開発者、（３）ワークフロー構築のためのクライアント開発者、（４）BioMOBY プロジェクト開発者が総勢 50 名ほど集まり、ライフサイエンスにおけるデータベースの相互接続性をたかめ、ワークフロー構築を容易にするための仕様策定や開発合宿（ハッカーソン）を行います。 初日（2/11）はアカデミーヒルズにてスタートアップのワークショップを行います。 アカデミーヒルズ http://www.academyhills.com/map/index.html ワークショップは、はじめにいくつかのプレゼンテー
The RWiki - Rubyで科学技術計算 まとめサイト
Ruby for Scientific Computing Rubyで科学計算する例の紹介です。事例追加をお待ちしています。 カテゴリは後で調整するかもしれません。-masa *1 *2 *3 *4 *5 Ruby科学計算関連総合 SciRuby - Since June 2005, by Ara T. Howard. るびま0006 Ruby Library Report [第5回] 数値計算と可視化 - 著者： 堀之内 武 各分野での利用 Mathmatics - 数学 Algebra - 計算代数 Polynominal - by 児玉さん Algebra - by 原さん - 多変数多項式環のグレブナ−基底の実装。 Ruby Mathematica - MathematicaへのRubyインタフェース。 「プログラミングのための線形代数」 - 平岡和幸著 Earth Science
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