定兼 邦彦 (Kunihiko Sadakane) - 圧縮接尾辞配列ライブラリ - researchmap
文字列を圧縮したまま検索するライブラリです． 文字列の一部を高速に復元することもできます． 圧縮接尾辞配列ライブラリ (2010-08-10版) Direct BWT construction External Memory BWT construction http://code.google.com/p/csalib/ にもあります． 注意: dbwt100717.zipにはバグがありました．Ubuntuでは動かない可能性が高いです． dbwt100730.zipを使ってください． 索引とは，本の索引と同じ意味で，検索を高速に行うためのデータのことです． ただし，本の索引では代表的な言葉のみが登録されていますが，このライブラリの索引は 任意の語が検索できるようになっています． このライブラリの索引は自己索引 (self-index) と呼ばれるもので，索引自体に 元のファイルの情報を全
Burrows-Wheeler変換の線形時間アルゴリズム - DO++
研究紹介です。今夏のSPIRE 2009という学会で "A Linear-Time Burrows-Wheeler Transform using Induced Sorting", D. Okanohara, K. Sadakane, SPIRE 2009 pdf(draft) というのを発表します。これは与えられた文字列に対し接尾辞配列を経ないでBurrows-Wheeler変換を直接行うというもので、アルファベットサイズによらず入力長に対して線形時間で行えます。基本的なアイディアは昨年のInduced Sortingによる接尾辞配列の線形時間構築アルゴリズム（いわゆるSAIS）を接尾辞配列を使わないでシミュレートするものです。pushとpop操作だけからなり、そのまま外部記憶上での構築とかにも対応できるようになっています。 Burrows-Wheeler変換（BWT, Block S
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