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Ag++
2014年10月05日03:48 カテゴリMDシミュレーション AmberToolsを使ったMDトラジェクトリの主成分分析 Amb... 2014年10月05日03:48 カテゴリMDシミュレーション AmberToolsを使ったMDトラジェクトリの主成分分析 AmberTools 14の解析ツール群cpptrajの中には主成分分析;PCA(Principal component analysis)を行う機能がついています。これを使うと、MDシミュレーション中で蛋白質構造の低い振動数での、いわゆる「構造のゆらぎ」をある程度可視化できるようになります。 以下では実際に得られたMDトラジェクトリからAmberToolsを用いてPCA解析を行う手順を解説していきます。 あ、統計の手法としてのPCA、主成分分析って何??って方はまず簡単に主成分分析についてググってくださいね。続きを読む ag_plusplus コメント( 0 )トラックバック( 0 ) 2014年05月31日00:08 カテゴリMDシミュレーション ACPYPE.p