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MySQL :: MySQL 5.1 リファレンスマニュアル (オンラインヘルプ) :: 9.11.3 テーブルの断片化解消
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テーブルのインデックスでランダムな挿入または削除が行われると、インデックスがフラグメント化される... テーブルのインデックスでランダムな挿入または削除が行われると、インデックスがフラグメント化されることがあります。断片化とは、ディスクでのインデックスページの物理的な順序が、ページでのレコードのインデックス順とかけ離れていること、またはインデックスに割り当てられた 64 ページのブロック内に多数の未使用ページがあることを意味します。 断片化の兆候の 1 つは、テーブルが 「必要とする」 以上の領域を取るということです。それがどの程度なのかということを正確に決めるのは困難です。すべての InnoDB データとインデックスは B ツリー内に格納され、それらの充てん比は 50% から 100% で異なっています。その他の断片化の兆候は、このようなテーブル走査に 「必要」 以上の時間がかかるということです。 SELECT COUNT(*) FROM t WHERE a_non_indexed_col