多重配列アラインメントについてです。 情報科学を専攻しているものです。…

多重配列アラインメントについてです。 情報科学を専攻しているものです。 最近ひょんなことから多重配列アラインメント（multiple sequence alignment）の研究をすることになったのですが、 バイオ系のことをさっぱり知らないので、どんなデータに対して、どういう評価値に基づいて 実験、解析を行えばいいのかがさっぱりわかりません。 とりあえず線形的なコストの最適化問題として解こうとは思っているのですが。。。 そこで、多重配列アラインメントを実験するときにはどのようなデータに対して、 どのように実験すればいいのかが分かる情報があれば教えていただきたいです。 この分野の教科書か、先行研究のサーベイなんかもあれば教えていただけると助かります。