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Snowflakeを用いたVCFフォーマットの遺伝子バリアントデータと表現型データベースとの統合
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データエンジニア兼バイオインフォマティシャンの是枝です。 業務でsnowflakeを触っていますが、snowfla... データエンジニア兼バイオインフォマティシャンの是枝です。 業務でsnowflakeを触っていますが、snowflakeの性能は素晴らしいものがあります。一方で、私は生物系研究者でもあり、普段はバイオインフォマティクスで研究しています。ゲノムデータを扱った解析をコンピュータの力で解析することがメインですが、ふと、snowflakeを使えばもっといい解析ができるのでは...?と思うことが増えてきています。そこでsnowflakeでできるバイオインフォマティクスにチャレンジしてsnowflakeとバイオインフォマティクスのコラボレーションの可能性を探ってみたいと思います。前半はVCFフォーマットの遺伝子バリアントデータとアノテーションデータをsnowflake上で統合してみます。後半は、snowflakeでバイオインフォマティクスに関して個人的意見を述べます。 ハンズオンは基本的にはこちらのバリ