遺伝子発現情報データベース NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) の使い方

NCBI GEO（Gene Expression Omnibus; 「ジオ」あるいは「ゲオ」と発音します）はNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。GEOには、主にマイクロアレイ実験で得られたデータが日々蓄積されており、その登録データ数は世界最大です。それらの中から、自分の興味のある発現データセットや遺伝子プロファイルを検索することができるだけでなく、それらの生データを自由にダウンロードすることが可能です。今回は、まずGEOの検索インターフェースを使って、自分の興味のあるマイクロアレイ実験データセットにたどり着く方法およびその生データのダウンロード方法について説明しています。