Avadis NGS の使い方〜RNA-seq編〜

今回の統合TVでは Avadis NGS による RNA-seq 解析の方法を解説します。 Avadis NGS は次世代シーケンサ(以下 NGS)から得られたデータの解析のための商用ソフトウェアです(無料で20日間試用できます)。Strand Scientific Intelligence 社が開発、日本では Agilent 社が販売しています。 Avadis NGS ではマッピングされたショートリードのデータ(SAM や BAM フォーマット)を読み込み、クオリティ・チェックを施した上で各種の解析およびその可視化を行う、という一連の流れを一つのソフトだけで行うことができます。 見どころダイジェスト 00:15 1.プロジェクトの作成 01:50 2.Interpretation の作成 03:20 3.クオリティチェック 03:56 4.フィルタリング 04:52 5.定量化 06:4

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この際なので、Agilentさんの講演のうらで宣伝1