計算生態学 - GLMM
混合 (効果) モデル，とくに一般化線形混合モデル (generalized linear mixed model; GLMM; 一般化線形混合効果モデルとも) を簡単に紹介するペイジです 混合ではない一般化線形モデル (GLM) については GLM 参照 を 混合モデルは fixed effects と random effects の項を同時にもつ統計モデルです [もくじ] 2010 年代のニュース ネット上の GLMM の解説 混合モデルを推定計算する R の関数たち 尤度を数値積分しようとする方法 MCMC 計算によって解決するもの 尤度近似数値積分などつかう方法 罰則つき擬似尤度 (PQL) つかう方法 正規分布の線形・非線型混合モデル もっと複雑な random effects をあつかいたい 書籍 2010 年代のニュース 2017-10-26 glmmTMB bioRxiv
生態学データ解析 - ベイズ統計 & MCMC
ここはベイズ推定と MCMC 法 (Markov Chain Monte Carlo method; マルコフ連鎖モンテカルロ法) 関連についてのペイジです 特に階層ベイズモデルについて [もくじ] ネット上の Bayes 推定・MCMC 計算の解説 「ベイズ推定を MCMC 計算で」なソフトウェアたち ベイズ推定と R ベイズファクターなど 書籍 べいじあんな生態学研究者 Ben Bolker Ottar N. Bjørnstad James S. Clark Kiona Ogle John Silader Christopher K. Wikle ネット上の Bayes 推定・MCMC 計算の解説 講義とか：統計学授業 や 出張統計学授業 解説記事： 岩波DS01 2016 階層ベイズモデルの解説記事 信学会誌ベイズ解説: 電子情報通信学会誌に書いた階層ベイズ解説 (2009 年 10
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