Bayes 法による系統解析－MrBayes 3.1.2
諸注意 この解説は MrBayes 3.1（最新版は 3.1.2）を使い始めるにあたって，マニュアル・ 参考書などを整理しながら書いています。 従って，細かいところで今後修正する箇所も出てくる可能性があることをご了承下さい。 特に世代数や burnin の値については他の研究者らがどのような値を用いるのか， 今後出てくる MrBayes 3.1 を用いた系統解析の論文なども参照したいところなので， このプログラムを実際に使ってみる場合にはご注意下さい。 MrBayes 3.1.2 には，当然ながらここで紹介した以外にも様々な機能や設定がありますので， 必要な場合には直接参考書や説明書をお読み下さい。 ここでは Windows XP，Vista の環境で系統解析を行うことを前提とした方法を書いていますが， Mac OS の場合でも OS に依存する操作の違いはありますが，大きな違いはないと思
BEAST Software - Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees | BEAST Documentation
What is BEAST? BEAST is a cross-platform program for Bayesian analysis of molecular sequences using MCMC. It is entirely orientated towards rooted, time-measured phylogenies inferred using strict or relaxed molecular clock models. It can be used as a method of reconstructing phylogenies but is also a framework for testing evolutionary hypotheses without conditioning on a single tree topology. BEAS
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MrBayes Tutorial - Bodega Phylogenetics Wiki
Morphometric methods for analyzing leaf shape variation
The hatchery culture of bivalves: a practical manual
http://www.diatom.org/efa/EFAOrigOutline.htm
Fourier Analysis of Outlines
