新型コロナウイルス染症COVID-19：最新エビデンスの紹介（４月18日） 今回のキーワードは，発症前感染の多さ，医療者の死を防ぐ対策，医療行為と感染リスク（非侵襲的陽圧換気と心肺蘇生），T細胞への感染，新規治療（レムデシビル，クロロキン，エブセレン）です．...
下畑 享良
新型コロナウイルス染症COVID-19：最新エビデンスの紹介（４月18日） 今回のキーワードは，発症前感染の多さ，医療者の死を防ぐ対策，医療行為と感染リスク（非侵襲的陽圧換気と心肺蘇生），T細胞への感染，新規治療（レムデシビル，クロロキン，エブセレン）です．...
下畑 享良
新型コロナウイルス染症COVID-19：最新エビデンスの紹介（４月18日） 今回のキーワードは，発症前感染の多さ，医療者の死を防ぐ対策，医療行為と感染リスク（非侵襲的陽圧換気と心肺蘇生），T細胞への感染，新規治療（レムデシビル，クロロキン，エブセレン）です．...
COVID-19診療での気管内挿管に「エアロゾル・ボックス」を！... | By 下畑 享良Facebook
COVID-19診療での気管内挿管に「エアロゾル・ボックス」を！...
COVID-19の感染爆発時における人工呼吸器の配分を判断するプロセスについての提言｜生命・医療倫理研究会
この提言の趣旨 この提言は、医療資源の調達について最大限の努力を行政や病院に対して求めています。それにもかかわらずCOVID-19の急性期医療を担う病院の集中治療領域おいて人工呼吸器等の救命医療に必須の医療資源が不足、払底した場合の対応を提案したものです。 そのさい、あくまでも患者さんの意向を中心に考えるとともに、どうしても医療資源の配分を行うことが不可避な状況においては、救急医療・集中医療の分野で広く共有された重症度の指標を用いて恣意的にならないように検討することを求め、記録を適切に行うこと、適宜倫理支援を受けること等、差別のない、公正で透明性のあるプロセスの重要性を訴えています。 私たちは、各病院で指針を作成するときに参照していただくことを期待していますが、この提言が妥当なのかは、それぞれの病院の倫理委員会等で必ず検討をしてください。また、個々の病院としての決定には限界があると思われる
SARSウイルスの巧みな戦略 | 理化学研究所
要旨 理化学研究所（理研）構造生物学研究室の村松知成研究員と横山茂之上席研究員らの研究チーム※は、「重症急性呼吸器症候群（SARS）コロナウイルス[1]」の主要なペプチド結合加水分解酵素「3CLプロテアーゼ[2]」が基質（酵素が作用する物質）を認識する際に示す新たなアミノ酸配列特異性を発見しました。 SARSコロナウイルスはヒトの細胞に感染すると、自己複製のために必要なさまざまなタンパク質を合成します。その中には2種類の巨大なポリタンパク質があり、それぞれ1本のポリペプチド鎖（アミノ酸がペプチド結合でつながったもの）の中に複数のさまざまな酵素類を含んでいます。それら酵素の一つ、プロテアーゼ[2]はペプチド結合(-NH-CO-)の切断を通じて、さまざまなタンパク質のN末端[3]やC末端[3]を正しく形成する重要な働きをしています。この反応に関わる主要な3CLプロテアーゼはポリタンパク質の一部
新型コロナウイルスに関連した研究機関・研究者、科学技術関連行政機関向けの情報提供：文部科学省
現在位置 トップ > その他 > その他災害等関連情報 > 新型コロナウイルスに関連した感染症対策に関する対応について > 新型コロナウイルスに関連した研究機関・研究者、科学技術関連行政機関向けの情報提供 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）を宿主又は核酸供与体とした遺伝子組換え実験を行うときの留意点について 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）を宿主又は核酸供与体とした遺伝子組換え実験を行うときは、カルタヘナ法に基づく文部科学大臣による拡散防止措置の確認が必要だったところ、「研究開発等に係る遺伝子組換え生物等の第二種使用等に当たって執るべき拡散防止措置等を定める省令の規定に基づき認定宿主ベクター系等を定める件」（令和３年２月15日施行。以下「告示」という。）を改正し、実験分類をクラス３として告示に追加しました。 引き続き、カルタヘナ法を遵守し、遺伝子組換え生物等を適切に使用い
新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）メインプロテアーゼの分子動力学シミュレーションデータを公開
理化学研究所（理研）生命機能科学研究センター計算分子設計研究チームの小松輝久研究員、小山洋平研究員、沖本憲明上級研究員、森本元太郎技師、大野洋介上級技師、泰地真弘人チームリーダーの研究チームは、新型コロナウイルス感染症（COVID-19）の原因ウイルスである「SARS-CoV-2」のメインプロテアーゼ[1]の10マイクロ秒間（1マイクロ秒は100万分の1秒）にわたる構造動態を、分子動力学（MD）[2]シミュレーション専用計算機「MDGRAPE-4A[3]」を用いてシミュレートしました。そして、その生データ[3]を世界の創薬研究者に自由に利用してもらうため、リポジトリ[4] Mendeley Dataにて3月17日に公開しました。 本データは、ウイルス増殖に必須であるプロテアーゼ活性を効率よく阻害する阻害薬の開発、候補分子のスクリーニングなどに役立つと期待できます。 コロナウイルスは一本鎖R
下畑 享良
新型コロナウィルス肺炎(COVID-19)：科学的エビデンスに基づいた議論の必要性． 今回のキーワードは，死亡の危険因子，子宮内感染，遠隔医療，隔離，感染メカニズムと治療標的分子，そしてもうひとつ「学校閉鎖のエビデンス」です．...
下畑 享良 2020年2月9日 · 新型コロナウイルス関連肺炎（NCIP）：深刻な医療従事者への感染，心的ストレス対策の必要性 新たな問題として，院内感染や心的ストレスが注目されています． ◆JAMA誌に，武漢大学中南医院から，最多の連続138名の入院患者のケースシリーズが報告された．症状は発熱，疲労感，乾性咳嗽の順に多く，呼吸器外症状としては筋肉痛，下痢，めまい，頭痛，嘔吐，腹痛を認める．検査異常はリンパ球減少（70.3％），プロトロンビン時間延長（58％），LDH上昇（39.9％）の順に多い．重症例で
新型コロナウイルス関連肺炎（NCIP）：深刻な医療従事者への感染，心的ストレス対策の必要性 新たな問題として，院内感染や心的ストレスが注目されています．...
下畑 享良 2020年2月5日 · 人工知能で新型コロナウイルス関連肺炎（NCIP）治療薬を見出す！ 私がNCIPの論文を熱心に読んでいる理由を知人に尋ねられた．理由は2つで，1つ目は日本でのアウトブレイクに備え，その臨床を知っておきたいこと，2つ目は世界中のアカデミア・製薬企業が，ワクチンが開発されるまでの間，どのように創薬を進めるか，その過程をリアルタイムで学びたいためである． これまでFBで投稿したように，2019-nCoVのゲノム配列，そして感染受容体の同定が，中国の研究者の努力で極めてスピーディ
人工知能で新型コロナウイルス関連肺炎（NCIP）治療薬を見出す！...
下畑 享良 2020年1月30日 · 新型コロナウイルス関連肺炎（NCIP）の流行様式：基本再生産数は2.2人 今朝のNEJM誌の論文で，NCIPの流行様式に関する最新情報が掲載されています．考えたくはないですが，武漢以外の地域においてアウトブレイクした場合に有益なデータになります．対象は425名のNCIPで，定義は4項目（発熱，X線所見，白血球正常・減少ないしリンパ球減少，最低3日間の抗菌薬治療で改善なし）を満たすか，3項目で疫学的要件（武漢海鮮市場，感染者との濃厚接触）を満たす者です．1月22日までの
新型コロナウイルス関連肺炎（NCIP）の流行様式：基本再生産数は2.2人...
下畑 享良 2020年1月26日 · 新型コロナウイルス（2019-nCoV）関連肺炎に関する論文の情報 昨晩，講演をした岐阜市内のホテルで，中国からの大勢の団体旅行者とすれ違った際，「新型肺炎への準備が必要だ」と思いました．中国の研究者チームは極めて速やかに2019-nCoVと名付けられたウィルスを単離し，全配列を解読して，そのデータを国際的に共有しました．SARSでの経験が生きたと言われています．NEJM誌とLancet誌は関連論文を無料公開しており，医療関係者は正しい情報を確認しておくべきと思われま
新型コロナウイルス（2019-nCoV）関連肺炎に関する論文の情報...
下畑 享良 2020年1月8日 · 【重要論文】なぜ動物実験で有効な脳梗塞治療薬が，ヒトの臨床試験で無効なのか？ 標題のテーマはしばしば議論されてきたことですが，決定版と言える論文がAnnals of Neurology誌に報告されました．著者らは，急性期脳梗塞に対する50の第3相臨床試験を対象として，その前段階に遡って，それぞれの薬剤の早期臨床試験と動物実験の3者において，研究デザイン，出版バイアス, 検出力(power), true report probability について比較しています．その結
【重要論文】なぜ動物実験で有効な脳梗塞治療薬が，ヒトの臨床試験で無効なのか？ 標題のテーマはしばしば議論されてきたことですが，決定版と言える論文がAnnals of...
東京都の感染者数倍加時間１０日の持つ意味 - 木走日記
■指数関数的増加と倍加時間 最近、新型コロナウイルスの「感染者爆発」という言葉に関連して「指数関数的」や「倍加時間」といった専門的な言葉が報道で使われています。 再度「指数関数的」増加と「倍加時間」について、わかりやすく説明いたします。 細菌の増殖を例に説明します。 細菌の増殖は速く、まな板を洗い流しても洗い方が悪いと数時間後にはその数は元に戻ってしまいます。 いったん細菌が培地に適応すると、数的な増加が指数関数的（exponential）に起こります。 理想条件下では１個のバクテリアでは７時間で 2,097,152個まで増殖することができます。 最初１個の細菌は２０分で分裂して２個に増殖します。 この個数が倍増する時間（20分）を倍加時間(doubling time)と呼びます。 したがってバクテリアでは1時間（６０分）に２×２×２＝８個に増殖します。 ] ※『木走日記』作成 つまり数学
Doubling time - Wikipedia
The doubling time is the time it takes for a population to double in size/value. It is applied to population growth, inflation, resource extraction, consumption of goods, compound interest, the volume of malignant tumours, and many other things that tend to grow over time. When the relative growth rate (not the absolute growth rate) is constant, the quantity undergoes exponential growth and has a
sken on Twitter: "前7日の陽性数は、発生レートの移動平均と等価です(7倍したもの)。なので、急峻な変動をノイズとして無視した値になります。 3/末の倍化時間は、7日より少し短いぐらいと思います。 (休校要請の顕著な効果は見られませんね。むしろ増加し… https://t.co/5nPvokJySg"
前7日の陽性数は、発生レートの移動平均と等価です(7倍したもの)。なので、急峻な変動をノイズとして無視した値になります。 3/末の倍化時間は、7日より少し短いぐらいと思います。 (休校要請の顕著な効果は見られませんね。むしろ増加し… https://t.co/5nPvokJySg
閃きの法則 on Twitter: "日本のコロナ肺炎感染者の増加移動平均です。 まだまだ増加の傾向です。ここから2週間後の4/22辺りにどうなっているかが注目ですよ。 その増減によってGW明けの予測が出来るでしょう。 行動範囲は狭く最短ルートで時間を掛けずに移動し… https://t.co/LyWChFodGU"
日本のコロナ肺炎感染者の増加移動平均です。 まだまだ増加の傾向です。ここから2週間後の4/22辺りにどうなっているかが注目ですよ。 その増減によってGW明けの予測が出来るでしょう。 行動範囲は狭く最短ルートで時間を掛けずに移動し… https://t.co/LyWChFodGU
Andante on Twitter: "感染者数の7日移動平均は減少、死者数の7日移動平均は横ばい、倍加時間も短縮しています。また重症者数も病床数よりはるかに少ないです。人口あたりの死亡率は西欧各国に比べて100倍ぐらい少ないです。全都道府県一律で緊急事態宣言を続ける積極的な理由が見当たりません。"
感染者数の7日移動平均は減少、死者数の7日移動平均は横ばい、倍加時間も短縮しています。また重症者数も病床数よりはるかに少ないです。人口あたりの死亡率は西欧各国に比べて100倍ぐらい少ないです。全都道府県一律で緊急事態宣言を続ける積極的な理由が見当たりません。
阿塁未央児 on Twitter: ">>かな？。 クラスター追跡の再構築しかないのにな。 大規模PCR検査と合わせた。 一週間移動平均をベースにn+1日/n日で比を取り、着目している区間の平均を取ることで等比級数に見立てて倍加時間を算出した。4/7～4/18は減少に… https://t.co/NWAShCEWgF"
>>かな？。 クラスター追跡の再構築しかないのにな。 大規模PCR検査と合わせた。 一週間移動平均をベースにn+1日/n日で比を取り、着目している区間の平均を取ることで等比級数に見立てて倍加時間を算出した。4/7～4/18は減少に… https://t.co/NWAShCEWgF
CoVID 19 Growth Rate
CoVID 19 Worldwide Growth Rates Updated: 1st May 2020, 03:34 BST All graphs have been updated. The way the UK reports deaths has changed to include all cases, not just hospital cases, and the graphs now reflect this. In general, many countries are showing signs of having peaked (number of new confirmed cases per day is now decreasing), and several are now showing signs that the death rate has also
東京都のCOVID-19陽性患者数に指数関数とロジスティクス関数をフィッティングしてみた - Qiita
背景 世界のCOVID-19感染者数のトレンドを指数関数とロジスティクス関数にフィッティングし、倍増する期間を計算している人がいました (https://github.com/aatishb/covid) ので、clone して東京都が公開している患者数のデータに当てはめてみました。 なぜ東京都かというと、全国のデータだと地域による事情の差が一つの分布に紛れ込んでしまうので、限られた地域で理想的な感染爆発のモデルに当てはめるほうが合わせこみやすかろうという考えです。また、国内では今一番リスクを抱えている地域でもあります。 分析方法や注意点は Notebook に書かれています。 結果 Notebook はこちらにあります: https://github.com/msakuta/covid/blob/master/curvefit-tokyo.ipynb ** Based on Most R
倍加時間 - Wikipedia
倍加時間（ばいかじかん、英語: doubling time）とは、何らかの数または量が2倍になるのに要する時間のことである。倍増時間（ばいぞうじかん）とも言う。人口増加・インフレーション・天然資源の採出量・物の消費量・複利計算・悪性腫瘍の大きさなど、時間の経過とともに大きくなる物に適用される。相対的（絶対的ではない）な増加率が一定の場合、量は指数関数的に増加し、倍加時間は一定になる。この場合、増加率から直接に倍加時間を計算することができる。 倍加時間は、2の自然対数を、増加率の冪指数で割ることで求められる。あるいは、パーセントで表した増加率の数値で70を割ると概算値が求められる。さらに大まかな値を求めるのに、70の代わりに約数の多い72を使う方法が良く知られており、「72の法則」と呼ばれている。 倍加時間は指数関数的増加方程式の特性単位（英語版）であり、倍加時間の逆の指数関数的減衰に対する
『新型肺炎COVID-19のデータについての私見 (2)』
とのとののブログ古代史，遺跡，SF，イスラム，男声合唱などの話題を備忘録かねて書いていきます。 男声合唱についてはホームページもあります。 メール頂く場合は，こちらにお願いします。 昔音源@gmail.com (mukashiongenにしてください) https://male-chorus-history.amebaownd.com/ 新型コロナウイルスSARS-Cov-2による新型肺炎COVID-19の感染拡大状況はどうなのか，日本の状況は国際的にどうなのかは，なかなかはっきりしない。イタリアやアメリカの感染拡大に比べ，感染者数が増え緊急事態宣言が発せられ警告されているとはいえ，患者数や死者数は感染が拡大している他国と比べ相当少ない。人口百万人あたりの感染者数や死者数は先進国の中で少なく，また3.5%と比較的高かった致死率は感染者数が増えたことで分母が大きくなり2.0%まで下がった(一
緊急事態宣言後と西浦モデル～コロナウィルスのデータサイエンス（その27） - computer_philosopher’s diary
緊急事態宣言後 緊急事態宣言が出ても、以前、宣言の趣旨があるいは、金銭的補償がはっきりしない状態が続いています。 最初に最近のデータを見ておきます。 図１は東京都の日当たり感染者数と経路不明の感染者数です。 いまのところ経路不明の感染者数の割合が増えてはいません。 感染爆発が始まると、赤線のように、経路不明者の割合が増えるはずです。 図１ 感染者数と経路不明感染者数 図２は東京都の日当たり感染者数と経路不明感染者数です。 これはYが線形軸です。 マスコミでは、日当たり感染者数が最大値を超えた、累積が、何千人をこえたという報道しかありませんが、 これは視聴率を稼ぐために、数的トレーニングのない一般の人の感覚に訴えることしか考えていないためと思われます。 2つの時系列とも増加はしていますが、非線形ではありません。 増加の状態はおそらく、次の3種類になると思われます。 線形的に増加している。 指
3週間後のコロナ状況を正確に予測できる｢DTチャート｣が示す真実 このままだと確実に感染爆発する
新型コロナウイルスの感染拡大の予測で、死亡者が2倍になる日数「DT」を使ったチャートが注目されている。英紙フィナンシャル・タイムズ（FT）の統計チームが公表しているもので、これをみると今後2～3週間の状況をほぼ正確に予測できる。予測のロジックを作家の橘玲氏が解説する――。 死亡者数の比較から見たコロナの現状分析 新型肺炎（新型コロナウイルス感染症）について、Financial Times（FT）の統計チーム（John Burn‐Murdoch）から提供されるグラフにもとづいて現状分析をツイートしているのですが、その背後にあるロジックをここでまとめておきます。なお、私は専門家ではありませんので信頼性は各自で判断してください。 各国の状況を見るのに、検査態勢が異なるため、感染者数の比較は意味がありません。それに対して死亡者数は、東アジアと欧米であれば、病院は肺炎の患者を必ず検査するでしょうから
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新型コロナウイルス感染症対策専門家会議2020.5.1付け状況分析・提言のデタラメについて(2020.5.2作成) やはり無能な専門家には退場していただくしかない！ #ガラパゴス定義
まとめ後半に収録してありますが、大事な事なのでテキスト引用します。 マキリンさんの連ツイ 最初のツイート https://twitter.com/MAKIRIN1230/status/1257119211068854272 ●まとめ (1)まず新規感染者数の確定日のデータがおかしい。 (2)確定日のデータから推定される新規感染者の感染日のデータがおかしい。 (3)推定された新規感染者の感染日のデータと平均感染期間から得られるある時刻での推定感染者数が、用いた平均感染期間が短すぎるため、おかしい。 （これはデータが示されていないけど） (4)ある時刻での推定感染者数がおかしいので、実効再生産数もおかしい。 時刻 t の感染者数 I(t) が集団に占める割合が少ない場合、実効実効再生産数 Rt は近似的に Rt≒1＋1/γ×d{ln I(t)}/dt と表せる。 岩波 科学 先行配信
新型コロナウイルスによる医療崩壊と日本の陽性者数の推移について｜suna
新型コロナウイルスの怖さは感染速度新型コロナウイルスの真の脅威は、その感染速度です。 新規の感染症は、初期には指数関数的に陽性者数が増加します。 指数関数的に陽性者が増加するというのは、一定の期間で、陽性者が1,2,4,8,16,32,64,...と倍々に増えていくということです。最初は増え方はゆっくりですが、後になればなるほど、増え方が激しくなっていくのです。 このような現象は、私達の日常で直接目にする機会はほとんどないですが、新型コロナウイルスの性質を知るためには最も重要なポイントで、外してはならない大前提です。これがあるからこそ、たとえ今の感染者数や死亡者数が少なかったとしても、決して軽視してはならないのです。 陽性者数が倍になる間隔を、倍加時間(doubling time, doubling period)といいます。この時間が短いほど、短期間で陽性者数が増えることになります。 そ
Quantifying SARS-CoV-2 transmission suggests epidemic control with digital contact tracing | Science
Quantifying SARS-CoV-2 transmission suggests epidemic control with digital contact tracing View ORCID ProfileLuca Ferretti1,*, View ORCID ProfileChris Wymant1,*, View ORCID ProfileMichelle Kendall1, View ORCID ProfileLele Zhao1, View ORCID ProfileAnel Nurtay1, View ORCID ProfileLucie Abeler-Dörner1, Michael Parker2, View ORCID ProfileDavid Bonsall1,3,†, View ORCID ProfileChristophe Fraser1,4,†,‡1B
Mosby's Manual of Diagnostic And Laboratory Tests - 5th Edition
This quick reference handbook offers clear, concise coverage of over 700 of the most commonly performed diagnostic and laboratory tests ― including 39 new to this edition. Trusted authors, Kathleen Pagana, PhD, RN and Timothy Pagana, MD, FACS, bring together a comprehensive collection of full color designs, illustrations and photos to show exactly how various tests are performed. Related tests are
上念 司
記者:実効再生産数について計算方法、求めるために使ったデータなどを詳しく教えていただけないでしょうか？ 西浦：ゴニョゴニョ、、、（忙しいので今は無理。検討します。） ソース：https://youtu.be/6hEVk0ZBgCI?t=5107 国民に対する説明が最優先じゃないのか？...
東京都医師会 広報 on Twitter: "緊急事態宣言が政府によって出されてから4 週間が経とうとしています。 新型コロナウイルスをなくすことができていない状況を踏まえ、東京都医師会より都民のみなさまへの再度のお願い「もしも、もう6週間みんなで頑張れたら」をホームページに… https://t.co/iJQ4jaUBPT"
緊急事態宣言が政府によって出されてから4 週間が経とうとしています。 新型コロナウイルスをなくすことができていない状況を踏まえ、東京都医師会より都民のみなさまへの再度のお願い「もしも、もう6週間みんなで頑張れたら」をホームページに… https://t.co/iJQ4jaUBPT
都民のみなさまへのお願い「もしも、もう６週間 みんなで頑張れたら」 | 公益社団法人 東京都医師会
「もしも、もう6週間みんなで頑張れたら」 4月7日に緊急事態宣言が政府によって出され、4 週間が経とうとしています。東京では全国に先駆けて、自粛をより強く求める緊急事態措置が発せられてから、みんなで頑張ってきましたが、完全には新型コロナウイルスをなくすことはできませんでした。 最近わかったことですが、新型コロナウイルスは発症する２日前の潜伏期間から感染力を持って人から人にうつるそうです。この時期は発症前ですから、感染していても自分が感染しているとは思いませんし、当然人にうつすことなど想像してもいません。 そうして無自覚のうちに感染させてしまった方の100人に5人は、命の危険にさらされてしまうのです。大切な命を守るために、私たちは気持ちを切り替えて戦い続けなくてはならないと考えます。 そこで、東京都医師会からのお願いです。みなさん想像してみてください。 新型コロナウイルスを、もしも今この瞬間
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脳神経内科当直医のための、新型コロナ感染を配慮した意識障害等の神経症候を呈する患者へ の救急外来対応マニュアル（ver 1） 2020 年 4 ⽉ 15 ⽇ ⼀般社団法⼈ ⽇本神経学会 ⼀般社団法⼈ ⽇本神経救急学会
下畑 享良
ClinicalTrials.gov
ClinicalTrials.gov
下畑 享良
下畑 享良
下畑 享良
下畑 享良
https://launch.sensely.com/?type=jacovid19&fbclid=IwAR1CnFcWDCvBQow29QC9EL41d3C2daZL6JePMcZjc0JAhNW5vdWmsCRJUF8
下畑 享良
下畑 享良
COVID-19 - American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery (AAO-HNS)
Anosmia - American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery (AAO-HNS)
下畑 享良
下畑 享良 2020年3月6日 新型コロナウィルス肺炎(COVID-19)：infodemicに屈せず，正しい情報を伝える大切さ．今回のキーワードは，ウィルス排出の持続，小児例，検疫の失敗，予後不良因子，RNA血症と抗体，東京オリンピックです．そしてもうひとつ，Lancet誌で「infodemic」について議論されています．災害時にデマはつきものですが，現代ではソーシャルメディアによりその情報が増幅し，ウィルスのように伝播します．その意味で「infodemic」という言葉ができました．WHOはネットを巡回
下畑 享良 2020年2月29日 · 新型コロナウィルス肺炎(COVID-19)：中国から学び，眼前の危機に立ち向かう時 今回のキーワードはトリアージ，胸部CT，PCRの再陽性化，無症状感染者，死亡の危険因子，医療者の精神的ケアです．良いニュースは，診断用ELISA kitの目処がたったこと，多数の臨床試験が開始され，ワクチンもすでに第1相に入ったこと，悪いニュースとしては日本の患者発生予測数が，上海並みの厳しい対策を行ったとしても，15～45万人（！）に達すると報告されたことです．大半が中国からの報告で
下畑 享良 2020年2月29日 · 新型コロナウィルス肺炎(COVID-19)：中国から学び，眼前の危機に立ち向かう時 今回のキーワードはトリアージ，胸部CT，PCRの再陽性化，無症状感染者，死亡の危険因子，医療者の精神的ケアです．良いニュースは，診断用ELISA kitの目処がたったこと，多数の臨床試験が開始され，ワクチンもすでに第1相に入ったこと，悪いニュースとしては日本の患者発生予測数が，上海並みの厳しい対策を行ったとしても，15～45万人（！）に達すると報告されたことです．大半が中国からの報告で
下畑 享良 2020年2月21日 · 【重要】新型コロナウィルス肺炎(COVID-19)：発症後２週間はウィルス排出は持続する 重要な情報が続々と報告されています．同僚から「SARS-CoV-2は生物兵器って本当ですか？」と質問されましたが，これに関連した科学者による声明も発表されています． ◆まずBMJ誌に報告された中国東部浙江省から62名の入院患者の後方視的な症例集積研究．武漢と比べて，若干，重症度が軽減している．原因として，診療経験が増したことに加え，もしかしたら89%もの症例で使用された抗ウィルス
Potential treatment for COVID-19 identified by BenevolentAI enters randomised clinical trial
BenevolentAI | AI Drug Discovery | AI Pharma
下畑 享良 2020年2月3日 · 新型コロナウイルス関連肺炎の潜伏期感染，画像所見，系統樹解析 この週末もいろいろ論文が発表されました．医療者として正確な情報を知っておきたいと思います． ◆NEJM誌からはドイツの報告で，潜伏期の患者との接触で，2名の感染者が生じたというケースレポートである（図１）．中国人（index patient）と接触し感染したビジネスマン（patient 1）の潜伏期において，接触した2名のビジネスマン（patient 3/4）が発症した．潜伏期における感染は感染予防対策の難し
下畑 享良 2020年1月28日 · 2019-nCoVへの抗ウイルス薬治療 気になるこの話題です．前回の投稿でも少し触れましたが，新型コロナウイルス（2019-nCoV）関連肺炎に対して，やはりHIV/AIDSに対して使用される抗ウイルス薬ロピナビル/リトナビル（商品名Aluvia）とαインターフェロン吸入薬によるオフラベル（適応外）治療が開始されているようです．このロピナビル/リトナビルは，過去に41名という小規模の臨床試験ですが，SARS-CoVに対し有効であったと報告されています（Thorax 2
Estimates of doubling time for exponential growth
指数関数的成長の倍加時間を推計する
SAS Blogs
SARS-CoV-2 and COVID-19: The most important research questions
Doubling Time of the COVID-19 Epidemic by Chinese Province30260-9%2Ffulltext)
Nowcasting and forecasting the potential domestic and international spread of the 2019-nCoV outbreak originating in Wuhan, China: a modelling study
30970-3%2Ffulltext)
First experience of COVID-19 screening of health-care workers in England
木根渕 猛 Takeshi Kinebuchi on Twitter: "#報道特集 #山梨大学学長 #PCR検査基礎研究者がやれ 高橋政代先生や日大の早川智先生などが警鐘、実験と臨床検査は違う事を医師である学長が完全に無視。検査で最重要なバリデーション、手技の標準化、器材の校正などのルーチンを無視して… https://t.co/7204Y6kgGY"
The tricky question of how long it takes for Corona cases to double | Rich Data
(PDF) Day Level Forecasting for Coronavirus Disease (COVID-19) Spread: Analysis, Modeling and Recommendations
sken on Twitter: "こちらは、発症日の補完の様子に興味がある人向け。 確定日基準、発症日基準、発症日の欠落を既知の確率分布で補完の３本をプロット。 https://t.co/6KisJXKx4N"
sken on Twitter: "「感染経路不明」に注目した分析です。 横軸は、公表日や確定日ではなく、発症日基準です。 東京都による詳細情報の更新を待ってから投稿しようと思っていましたが、情報の更新が数日間滞っているため、推定を含む形で投稿します。 源泉は… https://t.co/xasYEe9IZS"
yuichiro on Twitter: "人流データは平日と週末の１週間変動がきついので、１週間移動平均をとってこれをならしてみている。たぶん妥当な扱いだよね？"
yuichiro on Twitter: "オレンジの値は倍加時間の逆数に対応するもの 実効再生産数Rとすると、R−1に比例した値。 細かな上下があるのは、たまにガクッと新規感染者数が減ったり、増えたり(日曜検査なしとか、院内感染を一気に検査報告とか)を反映してしまうけど、… https://t.co/RG0VO4o8zA"
yuichiro on Twitter: "[人出の８割減は必要か？] 人出減の効果があれば、新規感染者数の片対数グラフの傾き(R-1に対応)が人口減少と相関するはず。 人流データ(Apple) https://t.co/cdwnCNrkqg を使い、日本全体の人出を1週間… https://t.co/np0F9GOQiP"![yuichiro on Twitter: "[人出の８割減は必要か？] 人出減の効果があれば、新規感染者数の片対数グラフの傾き(R-1に対応)が人口減少と相関するはず。 人流データ(Apple) https://t.co/cdwnCNrkqg を使い、日本全体の人出を1週間… https://t.co/np0F9GOQiP"](https://cdn-ak-scissors.b.st-hatena.com/image/square/812a1154d6a1795578506b5d2785b1ab9f23880d/height=288;version=1;width=512/https%3A%2F%2Fpbs.twimg.com%2Fprofile_images%2F1204016863333629954%2FmqmrtTfJ.jpg)
阿塁未央児 on Twitter: ">、こんなに努力しても減るペースのこの遅さよ。……さっきのスクショは日付を微妙に間違えていました^^A。"
阿塁未央児 on Twitter: "細かく一喜一憂しても……というのも分かるけれど、かなりあれやこれややっている身としては、161人ってのはアカンな。あ?!、金曜日(必ずしも金曜ではないと思う…)は民間検査が足されて、その分多くなる日。 それを考慮しても微増ぐらいの… https://t.co/lgEsbH3svJ"
yuichiro on Twitter: "R_0<1にするには、どれだけ、なにをしたら、、という議論が盛んで、それは大切だと思うけど、感染拡大しているときに日々のデータから現状を理解していこうと思うと、まどろっこしいんだよね。 要は感染者を減らせてるか？が見たいわけで、倍… https://t.co/qtPZ4Ws4G2"
yuichiro on Twitter: "あ、わかった。韓国と日本が同じ色で書かれていて、クロスしているから見間違えたのか、、これ紛らわしい。。 ということで、結果、自分の計算が合っているのが確かめられた。。"
yuichiro on Twitter: "あれ？ Financial Timesのコロナページ https://t.co/ENsA4jP5j3 これの確定感染者数(Daily confirmed cases 7 days rolling average)、日本推移のグラフ… https://t.co/UMwsQRod7j"
三毛猫🍎🐈 on Twitter: "あ。逆だな先週（126人）より増えているのか。"
三毛猫🍎🐈 on Twitter: "東京都のコロナ＋１３２人。先週よりちょっと減ったけど移動平均は激的には減らないな。もう倍加時間とかみても意味なさそうなので移動平均の半減期を見るべきか？"
Takaya Suzuki MD, PhD on Twitter: "宮城県の倍加時間は少しずつ伸びています。テクニカル指標として3日と7日の移動平均線もつけてみました。移動平均線を割り込むときが危ないのかな https://t.co/jaizZx4L2E"
Coronavirus 10-day forecast
MATLAB code for unrolling a moving average
Impact of meteorological factors on the COVID-19 transmission: A multi-city study in China
IBM Developer
AN EPIDEMIOLOGICAL MODEL TO AID DECISION-MAKING FOR COVID-19 CONTROL IN SRI LANKA
COVID-19 Statistics: Reading The Tea Leaves
Recreating John Burn-Murdoch’s Coronavirus tracker
(PDF) How to evaluate the success of the COVID-19 measures implemented by the Norwegian government by analyzing changes in doubling time
Doubling Time Not The Only Metric, Other Data Must To Make Post-LockDown Decisions, Experts Say
COVID-19 spreading: a model
https://www.mofa.go.jp/files/100045098.pdf
Relationship between COVID-19 death toll doubling time and national BCG vaccination policy
Covid-19: Estimates for Japan
https://www.kantei.go.jp/jp/singi/novel_coronavirus/th_siryou/kihon_h_0416.pdf
Japanese Government Initiatives for COVID-1930089-X%2Ffulltext)
Effect of changing case definitions for COVID-19 on the epidemic curve and transmission parameters in mainland China: a modelling study
Estimating the Asymptomatic Proportion of 2019 Novel Coronavirus onboard the Princess Cruises Ship, 2020
Visualising the doubling time of COVID-19 allows comparison of the success of containment measures
内科医のエビデンスに基づく医療情報 » 未分類
新型コロナウィルスの倍加時間時間に関する考察とその重要性(2020.2.15作成)
政府の専門家会議 感染者減でも「外出自粛などの継続」提言（2020年5月1日）
今の取り組み継続を 専門家会議が会見(全文1)治療薬・診断キット登場まで頑張ろう（THE PAGE） - Yahoo!ニュース
【福島県は東京より状況が悪い】専門家は感染の急速拡大に強い危機感 〔倍加時間という考え方〕
新型コロナウイルス 国内感染の状況
covid-19 of world wide (data source: https://ourworldindata.org/coronavirus)
John Burn-Murdoch on Twitter: "How does that look cumulatively? • US death toll has now passed Italy’s, and is on a much steeper slope than Italy… https://t.co/Pkv4ZZawsb"
昨日の専門家会議の記者会見で思ったこと｜まえはさま｜note
404 - Sorry..! page not found
東京 2020年4月25日（土）:記録32日目｜謎解きする人。｜note
COVID-19|Doubling Time|Analysis|2020
Accounting for super-spreading gives the basic reproduction number R0 of COVID-19 that is higher than initially estimated
DynaMed
Japan Macro Advisors | Unbiased Opinion on Japan's Economy
COVID-19 Doubling Time Model and Projections — Dan Reichart
笹山登生 on Twitter: "新型コロナウイルスの抗体検査問題盛んだけどサイト 「Antibody identification」 https://t.co/EfwKwrRUdH はわかりやすい。 抗体免疫ブログリンは5つ ①IgM-初期免疫応答 ②IgG-二… https://t.co/7JiPi7w7Eb"
禁煙外来医師 on Twitter: "新型コロナウイルス感染症の数は、診断がついた日、届け出があった日で通常カウントされるので、ばらつきがあるけど、発症した日でカウントするときれいな曲線になる。 国立感染症研究所のグラフ。… https://t.co/mLejBdR78a"
野良理科 on Twitter: "西浦「R0=2.5、0.4掛けでRe＜1」を「最近は感染率5倍！0.08掛けでRe<1、92％減！」って計算なのよな。現実には倍加時間の変化は小さい。 https://t.co/WnuEEGGJRF 「【新型コロナウイルス】横浜… https://t.co/wcBXFPgiJ4"
