第一巻 ゾイドゴジュラス対レッドホーンの戦い ZAC2030年、過酷な環境、ゼネバス帝国内部の砂漠地帯。 帝国領土の奥深くまで攻めこんできたゾイドゴジュラスに、レッドホーンが掴み上げられる。 武装で勝るレッドホーンも、ゾイドゴジュラスのパワーには苦戦を強いられていた。 ゴジュラスを上回る巨大ゾイド完成の日まで、 帝国軍はレッドホーンの改造タイプを多く生産することで時間を稼いでいた。 空前の新型ゾイド開発競争 フロレシオ海を進む共和国軍のフロレシオス艦隊。 共和国軍の新型ゾイド、バリゲーターのレーダーに上空から近づく影が映った。 それはゼネバス帝国がもたないはずの飛行ゾイド、エイ型のシンカーだった。 ZAC2031年は、陸上戦から海上、空中戦へと戦場が多様化した年であった。 帝国軍側にザットン、マーダ、ゲルダー、モルガ、シンカー、マルダー、ゲーター と魅力的な小型ゾイドが大量に登場した。 帝