PyStanでMCMC入門 - old school magic

概要 PyStan は Stan というMCMC計算用言語の Python インターフェイスです。 Stan http://mc-stan.org/ PyStan http://pystan.readthedocs.org/en/latest/index.html MCMCを計算できるソフトはいくつかあるのですが、Stan は C++で実装されているため高速 最近のサンプリング法を実装している といった特徴があります。特に速度には目を見張るものがあります。 前回までは PyMC3 をいじっていたのですが、他のソフトにも触ってみようと思い、今回は PyStan でモデリングをしてみました。 PyStan のインストール Anaconda を入れればもれなく一緒にインストールされます。 Anaconda https://store.continuum.io/cshop/anaconda/ 参考

[kent-where-the-light-is]

“PyStan は Stan言語のインターフェイスなので、Stan言語でモデリングを行い、Pythonから呼び出します。 今回のガウス混合モデルのモデリングはこんな感じです。これを gmm_mcmc.stan というファイル名で保存します。”

[monnalisasmile]

It's favorite way to try MCMC in Python