gnuplot でヒストグラム（頻度分布図）を描画する - Qiita

実は gnuplot だけで（しかもかなり簡単に）できます．filter の第二引数をいじれば，いくつごとにまとめるかが変わります． filter(x,y)=int(x/y)*y plot "hoge.dat" u (filter($1,0.001)):(1) smooth frequency with boxes

[jrf]

ここの方法は、0点で +0 と -0 が集計されて突出してしまう「バグ」があるようだ。他を読むと filter(x,y)=floor(x/y)*y + y/2.0 とすれば良いようだ。