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ASE (Atomic Simulation Environment) のase.mdモジュールを用いて,Ni結晶のMDシミュレーションをして... ASE (Atomic Simulation Environment) のase.mdモジュールを用いて,Ni結晶のMDシミュレーションをしてみます. モデル Ni (fcc) のバルクモデルを作成します. import numpy as np from ase.build import bulk from ase.build.supercells import make_supercell from ase.calculators.emt import EMT # Niバルク Ni_bulk= bulk('Ni', 'fcc', a=3.5, cubic=True) # 超格子 Ni_bulk = make_supercell(Ni_bulk, np.diag([3., 3., 3.])) # EMTを用いる Ni_bulk.set_calculator(EMT()) MDシミュレーショ