FANTOM5データを誰でも活用できる形に | 著者インタビュー | Scientific Data | Nature Portfolio

FANTOM5データを誰でも活用できる形に 川路 英哉、粕川 雄也、坊農 秀雅、小野 浩雅 2017年8月29日掲載 理化学研究所主宰の哺乳類ゲノムの国際研究コンソーシアム、FANTOM。現在の第5期FANTOM5では、500種類以上の細胞（臓器由来含む） について、ゲノムから転写されたRNAが網羅的に測定・解析された。FANTOM5データの多くはすでに公開済みだが、データ取得プロセスや試料の品質、データ処理などを詳しく記述した報告は、今回のScientific Data が初めてだ。同時に、FANTOM5などの遺伝子発現データを簡単に検索・閲覧できるウェブツール「RefEx」に関する論文も同誌に報告。公開データの活用を促すこれらの研究に尽力した4人のデータサイエンティストに話を伺った。 ―― FANTOMは、日本の代表的な国際研究コンソーシアムの1つです。その名付け親は坊農さんとお聞きし

[y_minami]

データ記述の意義について平易な解説。

[sayamatcher]

バイオハッカソンなう “データの共有を促進することが世界的に重要視されている現代、日本でもその動きが急速に加速していると感じます(中略)データのFAIR原則は、このバイオハッカソンから生まれたものです”