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Exon arrayに関するichanのブックマーク (29)

Wikiomics:Exon microarrays - OpenWetWare
Techno logy overview Overview of the GeneChip® Exon and Gene Array Systems: http://www.affymetrix.com/products/arrays/exon_application.affx Affymetrix White Papers: Alternative Transcript Analysis Methods for Exon Arrays v1.1 (pdf, 79 KB)]: [1] Exon Array Background Correction v1.0 (pdf, 78 KB): [2] Exon Probeset Annotations and Transcript Cluster Groupings v1.0 (pdf, 87 KB): [3] Exon Related Chang
ichan 2009/08/20
Exon array
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Comprehensive Analysis of Affymetrix Exon Arrays Using BioConductor
ichan 2008/03/15
Bioinformatics

Exon array
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http://xmap.picr.man.ac.uk/download/index.jsp
ichan 2007/05/28
CDFファイルがダウンロードできる．

Exon array
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マイクロアレイ解析 | Thermo Fisher Scientific - JP
日本人に特化したApplied Biosystems™ Axiom™ ジャポニカアレイ🄬 NEO さまざまな人種に対応したAxiom PMDA Arrayなど薬理ゲノミクス用Axiom PharmacoScan, PharmacoFocus Array SARS-CoV-2用ジェノタイピングアレイ Axiom Propel ワークフローソリューション遺伝子発現解析ジャポニカアレイ® は国立大学法人東北大学の登録商標です。ジャポニカアレイ® NEO は、Life Techno logies Corporation, part of Thermo Fisher Scientific Inc. が東北大学よりライセンスを受けて製造・販売しています。ジャポニカアレイ® NEO に搭載されている疾患関連 SNP マーカーはすべて研究用途です。
ichan 2007/05/28
mouseのsupport materials

Exon array
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Exon arrays provide accurate assessments of gene expression - PubMed
ichan 2007/05/28
BG modelの再検討．expression arrayとの一致が高まった．がそれでいいのかが不明．

Exon array
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http://bonsai.ims.u-tokyo.ac.jp/~yoshidar/IBSB2006_ExonArray.htm
ichan 2007/05/28
宮野研のひとのポスター

Exon array
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A statistical framework for genome-wide discovery of biomarker splice variations with GeneChip Human Exon 1.0 ST Arrays - PubMed
ichan 2007/05/28
宮野研

Exon array
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High correspondence between Affymetrix exon and standard expression arrays - PubMed
ichan 2007/05/28
exon arrayとexpression arrayの一致を見た論文．

Exon array
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SpliceMiner: a high-throughput database implementation of the NCBI Evidence Viewer for microarray splice variant analysis - PubMed
ichan 2007/05/28
Evidence Viewerの元論文．

Exon array
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http://discover.nci.nih.gov/spliceminer/
ichan 2007/05/28
直接関係はないが解析の役に立つかも．Entrez GeneのNCBI Evidence Viewer

Exon array
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http://biojoin.org/~kasukawa/d/?date=20070426
ichan 2007/05/28
Exon arrayとそのサブセットチップであるGene arrayの違いについて．

Exon array
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HugeDomains.com
ichan 2007/05/28
Exon arrayユーザのインタビュー．

Exon array
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splicegear
ichan 2007/05/28
BioCのASの解析，可視化ツール

Exon array
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dChip: Exon Array Analysis
ichan 2007/05/28
dChipでもExon arrayの解析が可能．発現アレイデータへconvertできる．

Exon array
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マイクロアレイ解析 | Thermo Fisher Scientific - JP
日本人に特化したApplied Biosystems™ Axiom™ ジャポニカアレイ🄬 NEO さまざまな人種に対応したAxiom PMDA Arrayなど薬理ゲノミクス用Axiom PharmacoScan, PharmacoFocus Array SARS-CoV-2用ジェノタイピングアレイ Axiom Propel ワークフローソリューション遺伝子発現解析ジャポニカアレイ® は国立大学法人東北大学の登録商標です。ジャポニカアレイ® NEO は、Life Techno logies Corporation, part of Thermo Fisher Scientific Inc. が東北大学よりライセンスを受けて製造・販売しています。ジャポニカアレイ® NEO に搭載されている疾患関連 SNP マーカーはすべて研究用途です。
ichan 2007/05/28
AffyがOpen sourceで出している解析ソフト．Exon Arrayのsummarizeや normalizationができる．

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exonmap
ichan 2007/05/28
BioCでsummarizeや簡単なdiff. exp.解析などができる．exon anovaやsplicing indexに対応している．

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An annotation infrastructure for the analysis and interpretation of Affymetrix exon array data - PubMed
ichan 2007/05/28
Exon arrayゲノムブラウザxmapの元論文．

Exon array
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http://xmap.picr.man.ac.uk/
ichan 2007/05/28
exon array向けのゲノムブラウザ．Google MapsのAPIを使っている?

Exon array
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Alternative Splicing: New Insights from Global Analyses - ScienceDirect
ichan 2006/12/25
ASのグローバル解析のレビュー

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MAASE: An alternative splicing database designed for supporting splicing microarray applications
ichan 2006/12/25
ASのhuman curation database

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