シーケンサー利用技術講習会 第8回 次世代シーケンサー用CAGEライブラリー作製実習講習会 | 2012 | イベント | 独立行政法人 理化学研究所 オミックス基盤研究領域
理化学研究所オミックス基盤研究領域では、保有する各種次世代シーケンサーを用いてシーケンサー利用技術講習会を開催します。シーケンサーは生命分子解析システムとして極めて強力な研究ツールであり、技術革新が著しいものですが価格が高価であるため必ずしも大学等研究機関において導入することが容易ではありません。そこで当研究領域では、最先端シーケンサーの利用を推進し、わが国における生命分子研究の充実を図るべく、保有するシーケンサーを用いて利用予定者等を対象として利用技術講習会を開催します。講習会は、次世代シーケンサーの知識習得、技術習得を目的とするもので、今回は、イルミナ社Genome Analyzer/Hiseq2000の機種の使用を想定しています。今回は、これまで行った基礎講習会をふまえ、実験に即した内容としてのアドバンストコースで、CAGEライブラリー作製の講習（講義と実習）を行います。今回の実習は
製品フィードバック2012〈10〉
方 法 はじめに（お客様コメント） Application Note 2012〈10〉 本稿の全てのデータにつきましては、理化学研究所発生・再生科学総合研究センター機能ゲノミクスユニット笹川洋平様のご厚意により 掲載させていただきました。ここに深く感謝申し上げます。 私は、日本ジェネティクスさんが売り出されている一連のKAPA製品と自作のIndex付きアダプターDNAを使うことで、高感度でロバスト な微量サンプル（0.1-10ng）対応のmultiplex-library preparation methodを完成させました。アプリケーションノートの検証では、同 スタートマテリアルからライブラリDNAを作製しており、収量・分布・内容にどれだけブレが生じたか調べています。検証結果を見ていた だければ、ライブラリ作製方法が非常に高感度でロバストであることが納得していただけると思います。検証で
Comparison of next-generation sequencing systems - PubMed
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エッペンドルフ社によるピペッティングのコツ
エッペンドルフ株式会社 @Eppendorf_JP ピペットをなんとなく使っているけど、この方法って正しいの？データが安定しないけど、改善方法がわからない！ピペットを管理したい！新人さんが入ってきた…そんな時にはピペットセミナーをご依頼ください。人数・場所に関わらず、どこでもお伺いして丁寧にご説明いたします。ご相談はお気軽に！ エッペンドルフ株式会社 @Eppendorf_JP 突然ですが皆様は、ピペットの持ち方にも正しい方法があることをご存知ですか？液面に対して、どんな角度で持てばよいのでしょう？30度？45度？？正解は、「垂直」です。まっすぐ持つことで、より正確性の高いデータが得られますよ。ぜひ、お試しください。 エッペンドルフ株式会社 @Eppendorf_JP ピペッティングのコツその２！皆さんはピペッティングの際、ピペットチップを液中にどれぐらいの深さまで入れていますか？1mm？
nanoluc_tech – Promega
テクノロジー概要 NanoLuc®とは NanoLuc®（Nluc）は深海エビ（トゲオキヒオドシエビ[Oplophorus gracilirostris]）由来のルシフェラーゼです。触媒活性のある19kDaのサブユニットを改変し、さらに本来の基質であるCoelenterazineをもとに作製したFurimazineという新しい基質を用いることで発光強度と安定性を高めました。発光レポーターとして最適なパフォーマンスを発揮するために作り出されたルシフェラーゼです。 参考文献 Hall, M.P., et al. (2012) ACS Chem Biol 7:1848 非常に高い発光レベル 高感度により正確な生体内イベントを検出可能 ホタルルシフェラーゼ (luc2)よりも80倍～240倍のシグナル（細胞内発現） 非常に小さいレポーター分子(19kD) ホタル/ウミシイタケルシフェラーゼやGFP
内部タンパク質を標的とした細胞の分離技術
1．目的と効果 現在の細胞分離技術では、フローサイトメトリーと呼ばれる、細胞を蛍光標識して分離する手法が最も一般的です。目的細胞の特異的な細胞表面抗原に対して、蛍光色素や磁気ビーズで修飾された抗体を用いることで、細胞の標識と分離が行われています。細胞表面だけでなく、細胞内部にも多くの種類のタンパク質が存在しますが、これら細胞内のタンパク質をフローサイトメトリーに適用することはできませんでした。この発明は、遺伝子組み換えなどを行うことなく、細胞内のタンパク質を標的とした細胞分離を可能にします。 ［適用分野］ ● 創薬分野 ● 再生医療分野 ● 細胞生物学分野 2．技術の概要 この手法では、図1の概念図に示すように、細胞内のタンパク質を標的として細胞分離を行います。直径200 nm、長さ10 µmの高アスペクト比の針「ナノニードル」を細胞に挿入し、細胞内部のタンパク質と結合させ、この
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Strand-Specific RNA-Seq Reveals Ordered Patterns of Sense and Antisense Transcription in Bacillus anthracis
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Determining long-range chromatin interactions for selected genomic sites using 4C-seq technology: From fixation to computation
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Bisulphite-sequencing of chromatin immunoprecipitated DNA (BisChIP-seq) directly informs methylation status of histone-modified DNA
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Thousands of Novel Transcripts Identified in Mouse Cerebrum, Testis, and ES Cells Based on ribo-minus RNA Sequencing
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