A complete workflow for the analysis of full-size ChIP-seq (and similar) data sets using peak-motifs - Nature Protocols
Thank you for visiting nature.com. You are using a browser version with limited support for CSS. To obtain the best experience, we recommend you use a more up to date browser (or turn off compatibility mode in Internet Explorer). In the meantime, to ensure continued support, we are displaying the site without styles and JavaScript.
ChIP-seq:実験のデザインと落とし穴 2 はじめに 次世代シークエンサー関連の論文 ChIP seq法によるタンパク質の動態解析 ーゲノムのどの場所にいつ結合するのかを明�
ChIP-seq:実験のデザインと落とし穴 2 はじめに 次世代シークエンサー関連の論文 ChIP seq法によるタンパク質の動態解析 ーゲノムのどの場所にいつ結合するのかを明らかにするー • タンパクの位置情報は様々な機能情報をもたらす – 既知の機能配列との相関。既知の機能タンパクとの相関 • 例えば二つのタンパク結合プロファイルが一致する – 二つは同じ機能を持つ複合体に帰属する可能性、制御関係にある可能性 を示唆 – 健常と疾患由来細胞におけるタンパクの振る舞いの違い ✴ 分子病態の解明 ゲノム上の位置 結 合 量 セントロメア テロメアテロメア 複製開始点 複製開始点 ChIP-seq法による制御系とタンパク複合体の予測例 Scc1 （コヒーシン） Sc
ESCAPE
This web-site was developed to support these two publications: Xu H, Ang YS, Sevilla A, Lemischka IR, Ma'ayan A. Construction and validation of a regulatory network for pluripotency and self-renewal of mouse embryonic stem cells. PLoS Comput Biol. 2014 Aug 14;10(8):e1003777 | PubMed | single cell and KD followed by RT-PCR data | Xu H, Baroukh C, Dannenfelser R, Chen EY, Tan CM, Kou Y, Kim YE, Lemi
リリース、障害情報などのサービスのお知らせ
最新の人気エントリーの配信
j次のブックマーク
k前のブックマーク
lあとで読む
eコメント一覧を開く
oページを開く
Esrrb Is a Pivotal Target of the Gsk3/Tcf3 Axis Regulating Embryonic Stem Cell Self-Renewal
ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia
Statistics for Next Generation Sequencing – Meeting Report
Clocks, Metabolism, and the Epigenome
Transcription factor co-localization patterns affect human cell type-specific gene expression - BMC Genomics
https://academic.oup.com/nar/article-abstract/40/15/e114/1223009
Integration of Hi-C and ChIP-seq data reveals distinct types of chromatin linkages
LCBB
https://www.liebertpub.com/doi/abs/10.1089/cmb.2012.0023
Grounded: Transcriptional Pausing in Naive mESCs
http://www.cs.ucr.edu/~stelo/papers/ISMB12.pdf
Determining long-range chromatin interactions for selected genomic sites using 4C-seq technology: From fixation to computation
Inferring direct DNA binding from ChIP-seq
Memetic algorithms for de novo motif-finding in biomedical sequences
Page Not Found | NEB
http://www.nature.com/nature/journal/v484/n7393/fp/nature10985_ja.html
http://www.nature.com/nature/journal/v484/n7393/standfirst/484171a_ja.html