Gene therapy for red–green colour blindness in adult primates Katherine Mancuso, William W. Hauswirth, Qiuhong Li, Thomas B. Connor, James A. Kuchenbecker, Matthew C. Mauck, Jay Neitz & Maureen Neitz Nature 　Advance online publication 16 September 2009 すごくインパクトのある論文だと思う。先天的に錐体視物質が一種類欠損していて色覚異常が見られるリスザルを、遺伝子導入で治療したという話。具体的にはウイルスベクターを用いて遺伝子を導入することで、欠損している錐体視物質を発現させようと試みた。それも成体になってから。そうすると遺伝子導入から20週を

AIC（赤池情報量規準）の赤池弘次さんが亡くなったらしい。享年81歳。日本人の名を冠した業績で、これほどよく利用されているものを他に知らない。 ちょうどラボに遊びに来ていた統計の院生（イスラエル人）がAICを使ってL0ペナルティの実装云々という話をしていたので、その赤池さんが先週81歳で亡くなったんだと言うと、「若っ！」と言って驚いていた。ちょっと不思議な反応ではあるのだけど、重要な業績を残した人は昔の人に思えるという感覚は判る。 訃報: 「AIC」を編み出した赤池弘次氏 (元統計数理研究所長) が死去 === 数理統計の人は業績に人名をつけるのが好きなような気がする。概念を簡潔に形容しがたいから、ということも関係するのだろうか。ベイズ推定もフーリエ変換も元々は人の名前。でもこのレベルになると単語自体が個人名を離れてある種のクオリアをまといだしているようにも思う。フーリエの頭文字がＦだった

高次視覚野細胞の反応を調べるに、モノを見たときに脳が一番気にしているのはそれがanimateかinanimateかということらしい*1。つまり、生き物（とくに動物）かそうでないか。 同僚（英語話者）と昼ご飯を食べていたらその話になったので、そういえば日本語ではanimate/inanimateは非常に重要な区分で、言及する対象がどちらであるか判断してからでないとうまく文が作れないんだよね、と言うとちょっと面白がられた。 つまり、beとかexistに相当する動詞として「ある」と「いる」があって、どちらを使うかは言及する対象が生き物なのかどうか、もっと言うと話者が生き物だと思っているかどうかによって決まる。面白いことにその中間はないので、日本語話者は常に「これは生き物なのか？」というちょっと哲学的な問いに答えることを強要されていることになる。英語ではニュートラルに「There is a rob

コンピュータサイエンス研究科で並列コンピューティングのセミナーがあるというので聞きに行く（ほとんど現実逃避）。印象に残った話をメモ。 自分の書くプログラムが2008年以降高速にならなくても良いという人を除き、全ての人は並列化プログラムを書く必要がある。 1980年代以降、RAM のアクセス速度は毎年 9% しか向上していない。このため CPU の処理速度との乖離が加速度的に増加している（いた）。これによる不具合を軽減するための仕組みとしてキャッシュメモリがあり、プログラムの実行速度はキャッシュのヒット率に大きく依存する。 アルゴリズムやデータサイズによってキャッシュのヒット率は異なる。更に最近の CPU はそれぞれ容量・速度の異なるキャッシュを多段に装備している。このため、どのアルゴリズムがどういうサイズの計算をするときに最適なのかはもはや誰にも予測できない。 並列化なんてしたら更に訳がわ

ビザ更新（J1とJ2。visiting scholar とその家族。）のためにしばらくカナダ・バンクーバーに行っていた。 現在のところアメリカ滞在のビザ申請・延長をするにはアメリカ国外にある大使館・総領事館に出向いて面接を受けないといけない。このため長期滞在中の研究者もビザ更新の際には一度アメリカを出国する必要がある。ちょっと面倒ではあるけれど、そんなに頻繁にあることではないので（１回／雇用契約）休暇がてらの海外旅行という感じ。日本に帰ることも考えたけれど、原油高騰の影響で飛行機代もばかにならないので近場のカナダ・評判の良いバンクーバーへ。Web上から面接予約をして前日にカナダ入り。 面接時に提出した書類 DS-2019　（勤務先に作成してもらったもの。J1とJ2それぞれに必要。） DS-156　（ビザ申請書。Web上のフォームで作成。写真添付。J1とJ2。） DS-157　（申請書補足１

科学者の論文数とビール消費量との間には負の相関があるらしい。 For Scientists, a Beer Test Shows Results as a Litmus Test By CAROL KAESUK YOON The New York Times, March 18, 2008 たぶん元ネタとなった論文はこれ。 A possible role of social activity to explain differences in publication output among ecologists TomášGrim Oikos Volume 117 Issue 4 Page 484-487, April 2008 世の中にはどんどん論文を書いてどんどん有名になる科学者がいる一方で、そうでない科学者もいる。この違いを生む要因はなんだろうかと考え、科学者の生産性（論文数など）

人毛の１万分の１　「世界最小ラジオ」米で開発、医療分野へ応用も （via: Nao_uの日記） Nanotube Radio K. Jensen, J. Weldon, H. Garcia, and A. Zettl Nano Lett., 7 (11), 3508 -3511, 2007. Supplementary materials（動画など。もちろん音声付き） 分子１個で電波の受信だけでなく送信もできるらしい。これ上手くやれば電気生理の道具として使えるんじゃないだろうか。目的の場所までガラス電極で運んで electropolation して細胞内導入とか？　それぞれ異なる周波数の電波を出すように調整すれば、ワイヤレスで多細胞同時記録なんかも出来たり？　どのぐらいの強さの信号を出せるのだろう。ナノチューブが細胞内でとどまっているなら、クロニックに長期記録も可能？　そもそもどういう信号

同僚のポスドクが一人、アカデミアの世界から去ることになった。研究室に来て３年、芳しい結果が出せず、夫婦でアカデミアの世界に居続けることはほぼ不可能（奥さんもアカデミアの世界で生きている。）と判断し、彼のほうが身を引くことにしたと。 次の職は見つかったのかと聞くと、幸いにもすぐに見つかったとの事。２つの企業からオファーを受けていて、１つは初年度給与が約１２００万円、もう一つは約２２００万円。それは今の年収の何％増だっけ？　と考えるのもばからしくなる。ラボで日常的に使っているＸＸやＸＸＸなどの話をすれば、企業で職を得るなんて楽勝だったとのこと。そういうものか。しかも土日祝日は休みらしい。 話すたびに違うことを言うので、実際の心中はどうなのか判らない。ただ、周りの同僚が派手に（某同僚）あるいは控えめに（potasiumch）結果を出しつつあるのを横目に、どれだけやっても結果が出ない状態*1が長く

Wired Vision にこんな記事が。どう捉えて良いのかよく判らない記事だけどメモ。 「脳で操作するゲーム」が登場、危惧の声も Emmet Cole　2007年09月11日 頭で考えるだけでコンピューターを操作できる「ブレイン＝コンピューター・インターフェース」(BCI)を使ったデバイスのメーカー数社によると、BCI技術は2008年にも、医療分野から消費者向けゲーム市場へ進出を果たせる状態にあるという。 2008年にはゲーム会社からBCI対応ゲームが本当に発売されるかもしれない。だがその一方で、多くの研究者が、ユーザーの脳に悪影響が及ぶことを心配している。 たとえば、BCIデバイスは時としてユーザーの脳波を遅くすることがある。その後、注意を集中させるのに困難を感じたというユーザーの報告もある。 「脳波を遅くする（原文：slow down their brain waves）」という表現

ものもち話３題。 - 実験上ちょっと特殊な器具が欲しくなったので、研究科付属の工房に頼んで作ってもらおうかという話をしていた。そうするとボスがキャンパス内の同業者に聞いて、そういう器具を持っていて貸してくれる人がいないか調べてくれることになった。その結果、実験系をたたんでしまうという教授がいて、必要なものがあれば何でも持って行って良いという話に。 で行ってみたら、ちょうど目的のものがあった。他にも買えば数十万円から数百万円はする機材がごろごろあり、うちで使いそうなものをいくつか有難く頂く。すばらしい。何でも言ってみるものだ。これ今回は部品単位の話だけれど、自分でラボを立ち上げるときにこういう機会に恵まれるかどうかはかなり大きな差だよな、と思った。 キャンパス内に限らず、神経科学者ＳＮＳとか、同業者コミュニティでこういう「ください／あげます」情報がやり取りできれば良いと思う*1。でも日本の大

プレゼンで青背景に黒字を使う人がいるけど見難いのでやめてほしい。視覚の専門家であるはずの人たちがこれをやるのを見るとちょっとドキドキする。 ヒトの網膜には光電変換を行うための光受容細胞（デジカメにおけるＣＣＤ素子みたいなもの。）が並んでいて、 青に近い波長に感受性を持つ光受容細胞（Ｓ錐体細胞）は、錐体細胞全体の５％程度しかない（下図）。 Ｓ錐体細胞は最も解像度の高い（光受容細胞が密に並んでいる）網膜中心部には存在しない。 最大解像度の得られる緑や赤の波長の光が網膜上で焦点を結ぶようにレンズを調整した場合、青波長の光は網膜上で収束しない。つまりぼやける。 これらのセンサー段階での特性により、黒vs.青などの青い光の有無しか判別の手がかりがない文字や図形は、それ以外の手がかりが使えるもの（黒vs.緑とか、黒vs.水色（緑+青）とか）に比べて著しく見難い。 （ヒトの網膜の一部を拡大したもの。丸い

（追記あり：8/16） 日本では携帯小説（携帯で読める小説？　携帯で書いた小説？）というのが話題らしい。で、そこで書かれている文章がひどいという話があるらしい。でも例に挙がっている一人の著者に関して言うと、そこにはある種の規則があるような気がする。例えば、 二人が向かった先は地元で有名なスーパーに足を踏み入れた。 いざ、着地してみるとそこは森の様な草むらに二人は降り立っていた。 気がつくとそこは十字路の真ん中に二人は立ち止まっていた。 ハッと後ろを振り返った翼の目に映っていたのは、輝彦と同年代くらいの紳士がこちらを向いていた。 （『リアル鬼ごっこ』山田悠介著（文芸社）より*1） 8/16追記：『リアル鬼ごっこ』の初出は自費出版なので携帯小説というわけではないらしい。 id:umeten さんによるトラックバック先エントリの id:tomoki_hot さんによるコメントより。定義がよく判っ

ゲシュタルト崩壊をネタにして何か実験できたら面白いよね、と同僚に雑談を振ろうとしたら予想外に苦労した。まずゲシュタルト崩壊を英語でなんて言うのか判らない。ドイツ語（Zusammenbruch der Gestalt）はあるけど英語は？　breakdown?　collapse? 何とか概念を把握してもらったのは良いのだけど、そんなこと経験したことがないし、聞いたこともないと言われる。確かにアルファベットは単純であまりゲシュタルト崩壊しないのかも。台湾系の院生だけが実感として理解してくれた。でも今日初めて知った現象だという。あんまり有名な概念ではないのかもしれない。実験できたら漢字圏の科学者の独壇場かも。 - Wikipedia によると ゲシュタルト崩壊 - Wikipedia ゲシュタルト崩壊とは心理学における概念の一つで、全体性を持ったまとまりのある構造(ドイツ語でゲシュタルトGesta

ボスが出張から帰ってきた。どうも理論系の神経科学者（以下理論屋）が 国家予算にサポートされて得られた全ての実験データは国民の共有財産であり、公開を義務付けられるべきものである。実験者による独占は許されない。 と科学予算の配分を決める某政府機関に訴えたらしい。ボスはその訴えに関する実験系科学者（以下実験屋）サイドからの参考人の一人として呼ばれたと。実験データ共有をめぐる実験屋 vs. 理論屋の微妙な関係というのは日本でもあったけれど、スポンサーに訴えて強制力を持たせようとするとは。なかなかやるなあ。 実験屋の意見としては： Ａ：「まあいいんじゃない？　もう Neural Prediction Challenge とかもあるし、ボランティアとしてデータの一部を提供するのは別にかまわないよ。」 （理論系に近い実験屋の某教授） Ｂ：「共有するのはいいけど、そうするとサポートとか余計な仕事も増えるわ