細胞内におけるタンパク質-DNA相互作用の全体像を捉える新しい方法を開発 | 研究成果 | 九州大学（KYUSHU UNIVERSITY）
九州大学大学院医学研究院医化学分野の梅山大地学術研究員（現：理化学研究所）と伊藤隆司教授は、細胞内におけるタンパク質-DNA相互作用の全体像を捉える新しい方法を開発しました。 私たちの身体を形成している様々な細胞は、基本的に同一のゲノムDNAを持っていますが、ゲノム中の遺伝子を取捨選択して使うことによって、それぞれの個性を発揮したり環境変化に適応したりしています。この取捨選択を行うのがDNAに結合する転写因子やヒストン等のタンパク質です。したがって、ゲノムの働き方を包括的に理解するには、ゲノムDNA上のタンパク質結合部位を網羅的に明らかにする必要があります。そのために、細胞から単離した核にDNA切断酵素を働かせる方法が用いられています。しかし、これらの方法は、操作が煩雑な上に、核を単離する過程でDNAとタンパク質の相互作用が失われる危険性も有しています。 これに対して、梅山博士と伊藤教授は
酵母研究若手の会
Twitter, Slack はじめました 酵母研究若手の会 @koubowakate 酵母研究若手の会のツイッターアカウントです。 Slackも始めました！自分の研究紹介や実験等の質問などを行っています。興味のある若手研究者(大学院生も含む）の方は、こちらのフォームからぜひ登録をお願いいたします。 (こちらからSlackに招待いたします。) 酵母研究若手の会第10回研究会の詳細が決定しましたのでお知らせします。 今回は対面とオンラインでの開催となります。 日程：2024年8月6日 (火)、7日 (水) 場所（形式）：東北大学 新青葉山キャンパス 農学研究科（オンライン併用） 現地定員: 30人（先着順、ただし発表者優先） ＜参加資格＞ 酵母を用いた研究に興味を持つ若手研究者（大学院生も参加可能）参加者を広く募集しますので、若手研究者及び大学院生の方々の積極的な参加をお待ちしております。
染色体上からリボソームRNA遺伝子が消えた細菌を発見 ～ゲノムの常識を覆す～
東北大学大学院生命科学研究科の地圏共生遺伝生態分野と遺伝情報動態分野の微生物研究グループは、環境細菌Aureimonas（オーレイモナス）のリボソームRNA遺伝子が、安定的に維持される染色体ではなく、プラスミドに位置していることを明らかにしました。これまでは、生命の根幹をなすリボソームRNAの遺伝子は染色体上にあるのが当然と信じられてきました。本研究により、生息環境に適応して進化する過程で、細菌のゲノムは予想外にダイナミックに変化していることが示されました。本研究は、生物一般のゲノムに関する常識を覆し、遺伝の仕組みに対する研究に新たな視点を与えるものです。本研究結果は、平成27年11月3日付けで米国科学アカデミー紀要『Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS)』
なぜバイオインフォマティクスの解析はタダではないのか - こんな時間ですがパスタを茹でます
この記事は Why Bioinformatics Analysis Is Not Free - MassGenomics http://massgenomics.org/2015/10/ngs-analysis-not-free.html の日本語訳です。ところどころ意訳していますが、主旨は変えていません。 This article is translated from “Why Bioinformatics Analysis Is Not Free - MassGenomics” http://massgenomics.org/2015/10/ngs-analysis-not-free.html . I would like to thank Dan for his great and important blog post! == NGSの発展は遺伝学の分野にとって大きな助けになってい
第21回酵母合同シンポジウム
本シンポジウムは終了いたしました。 どうもありがとうございました。 更新情報 2014-09-12 本ページ左欄に、「酵母合同シンポジウム企画 第2回産業酵母検定」の問題および正解と解説を掲載しました。 2014-08-29 プログラムのページに講演要旨を追加公開。 2014-08-25 プログラムのページに講演要旨を追加公開。 2014-08-22 プログラムのページに講演要旨を追加公開。 2014-08-20 プログラムのページにて、講演要旨の公開を一部開始しました。順次追加してゆきます。 開催概要 会期 2014 年 9 月 3 日（水）、4 日（木） 会場 東京大学 伊藤国際学術研究センター 伊藤謝恩ホール （東京都文京区本郷 7-3-1 東京大学本郷キャンパス内） 主催 特定非営利活動法人酵母細胞研究会 第21回酵母合同シンポジウム実行委員会 共催 イーストワークショップ、酵母遺
The American Society for Cell Biology | A Global Cell Biology Community
The new research report “Design principles of Cdr2 node patterns in fission yeast cells” was recently selected as an MBoC Highlight. Our interview with the first author Hannah Opalko discusses cell cycle regulation, the beauty of fission yeast, and making the transition from academia to industry. Introduce yourself: I became interested in science through my…
E. Rothman, R.W. Schekman, T. Südhof にノーベル医学生理学賞
E. Rothman, R.W. Schekman, T Südhof に2013年のノーベル医学生理学賞が授与されることが決まりました。 それぞれの受賞者の人柄などのツイートを含め、業績内容の分かる周辺ツイートをあつめました。 業績内容はこちらのまとめにも紹介されています。 http://togetter.com/li/574050
ニホンウナギから人類初のビリルビンセンサー | 理化学研究所
ポイント ニホンウナギの緑色蛍光タンパク質UnaGはビリルビンと結合して光る ビリルビンを高感度、迅速、正確に定量する試薬を開発、新生児核黄疸の予防に効果的 ビリルビンの抗酸化作用に注目、ヒトの健康および疾病を診断する試薬として期待 要旨 理化学研究所（理研、野依良治理事長）は、ニホンウナギの筋肉に存在する緑色蛍光タンパク質が、バイオマーカーとして有名なビリルビンと結合して蛍光を発する仕組みを発見しました。この成果を応用して、ヒトの血清などに含まれるビリルビンを直接的に定量する蛍光検出試薬（ビリルビンセンサー）を開発しました。これは、理研脳科学総合研究センター（利根川進センター長）細胞機能探索技術開発チームの宮脇敦史チームリーダー、熊谷安希子基礎科学特別研究員らの研究チームによる成果です。 ニホンウナギは、産卵海域（マリアナ海嶺）の発見や昨今の漁獲高激減など、話題の絶えない魚です。2009
ニホンウナギから人類初のビリルビンセンサー - YouTube
ニホンウナギの筋肉に存在する緑色蛍光タンパク質が、バイオマーカーとして有名なビリルビンと結合して蛍光を発する仕組みを発見しました。この成果を応用してヒトの血清などに含まれるビリルビンを直接的に定量する蛍光検出試薬（ビリルビンセンサー）を開発しました。 2013年6月14日プレスリリース「ニホンウナギから人類初のビリルビンセンサー」 http://www.riken.jp/pr/press/2013/20130614_1/ 発表者： 理研脳科学総合研究センター 細胞機能探索技術開発チームの宮脇敦史チームリーダー、熊谷安希子基礎科学特別研究員らの研究チーム 理化学研究所：http://www.riken.jp/
原生生物研究の魅力
早川昌志 ミクロ・ライフ @Markchloro 「将来、昆虫の研究をするんだ」とか、爬虫類の研究をするんだ」、と夢語る子供達は多いけど、「将来、原生生物の研究をするんだ」って夢語ってくれる子供はまずいないだろう。だから、「将来、原生生物の研究をするんだ！」って夢語ってくれる子供達を増やす為に、原生生物の知名度を高めていきたい。
第3回（2013年）日本分子生物学会 若手研究助成 募集のお知らせ - 日本分子生物学会
2013年1月 本学会では、2010年、富澤純一博士と故・桂子夫人のご厚意を受け、「日本分子生物学会 若手研究助成 富澤純一・桂子 基金」を立ち上げ、2011年度より若手研究助成事業を開始いたしました。本研究助成は、生命科学の基礎的研究に強い熱意をもって携わっているが、必ずしも研究資金に恵まれていない若手研究者を対象にしており、助成金の使途を直接的な研究経費に限定しないという我が国ではユニークな助成制度であります。 2013年度も以下のように募集いたします。助成をご希望の方は、下記の応募要項に従ってふるってご応募ください。 特定非営利活動法人 日本分子生物学会 理事長 大隅 典子 「日本分子生物学会 若手研究助成 富澤純一・桂子 基金」 基金運営委員会委員長 山本 正幸 【第3回（2013年）の応募は締め切られました】 【 応 募 要 項 】 1. 研究助成金の趣旨 分子生物学に関連する生
細胞の創傷治癒においてプロテアソームによるタンパク質分解により細胞極性のダイナミックな切替えが起こる : ライフサイエンス 新着論文レビュー
河野恵子・David Pellman （米国Dana-Farber Cancer Institute，Department of Pediatric Oncology） email：河野恵子 DOI: 10.7875/first.author.2012.103 Proteasomal degradation resolves competition between cell polarization and cellular wound healing. Keiko Kono, Yasushi Saeki, Satoshi Yoshida, Keiji Tanaka, David Pellman Cell, 150, 151-164 (2012) 要 約 細胞膜における局所的な損傷を修復する細胞の創傷治癒の機構は進化的に保存されている．細胞の創傷治癒におけるひとつの側面は，細胞骨格および極
NGS現場の会
NGS現場の会とは？ NGS現場の会は、21世紀に登場し生命科学分野に革命を起こした新しいシーケンステクノロジー（いわゆるNGSテクノロジー）をテーマとした、新しい研究コミュニティです。 NGS現場の会では、立場や分野を超え―—すなわち学生も教授も、研究者も技術者も営業職も、大学・研究所からも産業界からも、そして医学・農学・薬学・工学から基礎科学まで―—オープンでフラットな交流を行います。その核となるのが、私たちのかかげる“現場”というコンセプトです。現場とはすなわち、多様な生命現象に魅せられ、目の前にある疾患や技術的問題を克服することを目指し、あるいは解析や実験のための手法や製品に誇りとこだわりを持つ、みなさんのことに他なりません。 急速に進むNGS分野の技術革新を受けて、NGS現場の会は研究会に700名の参加者を集める、世界的に見てもユニークなコミュニティに成長しています。NGSに興味
ヒ素細菌のDNAにはヒ素がなかったーライバル研究者らが発表 - むしブロ＋
今週からアメリカのアトランタで行われている、NASA主催の宇宙生物科学会議(Astrobiology Science Conference)に出席しています。本日、会場では「ヒ素細菌のDNAにはヒ素がなかった」とする研究発表がありました。 2010年末にNASAのWolf-Simon博士らが大々的に発表した、細菌GFAJ-1がヒ素をDNAの部品として使うことができるという発見。この発見の報告直後から、データの信憑性や実験方法の問題について、多くの指摘がされてきました。そしてついに、他の研究者らによる追試がなされ、GFAJ-1はDNAにヒ素を取り込まないとする結果が発表されたのです。 GFAJ-1. Image from Wikimedia ここで、Wolf-Simon博士らが発表した元々の研究内容を手短に説明します。 彼女らは、カリフォルニアにあるヒ素濃度の高いモノ湖から単籬した細菌GFA
About - iRefWeb - Wodak Lab
You have: discovered a protein or a gene likely to be involved in a disease, and you want to find out what is known about its interactions with other proteins. identified a group of co-expressed genes, and would like to check if the proteins they code for interact physically. found a set of genes associated with a specific phenotype, or a cellular process and would like to prioritize them for furt
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第15回日本エピジェネティクス研究会年会
Simple-to-use CRISPR-SpCas9/SaCas9/AsCas12a vector series for genome editing in Saccharomyces cerevisiae
How CRISPR lets us edit our DNA
http://hismoriya.com/HMwiki/index.php?%E6%88%90%E6%9E%9C%E7%99%BA%E8%A1%A8%2F%E8%AB%96%E6%96%87%E7%99%BA%E8%A1%A8%2FgTOW6000%E8%AB%96%E6%96%87
Heavy use of equations impedes communication among biologists