基本的には問題ありませんが、コンデンサの種類は同じである必要があります。たぶん容量・耐圧から考えてたぶん電源回路のものであると思われますが、コンデンサはその種類によって、周波数特性などが大きく異なりますので、注意が必要です。たぶんアルミ電解コンデンサだと思うのですが、ESR値があまり低いと問題が出る可能性があります。あと自動車用とのことなので、温度特性も気になるところで、一般的な耐熱温度は105℃のものと125℃のものがありますが、同一もしくは上位のものを使用する必要があります。使用されているコンデンサの詳細はコンデンサメーカーのサイトで調べられます。ケースにメーカー名の表示があるはずなので確認してください。
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