DNAの読み取りについてプログラマーが誤解していること

世の中にはDNAの読み取りを使った技術が実用されすぎている。DNAを使った生物の共通祖先の判定、人間の出アフリカ以降の移動の推定、特定の病気にかかりやすい遺伝子を持つかの判定、親子鑑定、刑事裁判におけるDNA鑑定などなど。 あまりにもDNAの読み取りを使った技術が実用化されすぎているため、世間ではDNAの読み取りは簡単なものだと考えている。プログラマーとて例外ではない。 大抵のプログラマーはヒトDNAの読み取りを以下のように考えている。 「一本の長い磁気テープを先頭から末尾までシーケンシャルにリードする」 より現実的に例えると以下のようになる。 長さ30kmの長大な磁気テープをだいたい長さ1cmのテープ片に切断する 上記1cmのテープ片を数百本複製する 上記複製した数百本の1cmテープ片をマイクロメートル単位のテープ片にズタズタに切り裂いて混ぜ合わせる 上記混ぜ合わせたマイクロメートル単位

[oooooo4150]

タイトルDNSに空目した

[ka-ka_xyz]

刑事事件のDNA鑑定はそんな読み取りするとこまで行くのはそう滅多に無い（大抵は繰り返し配列をぶつ切りして"指紋"を見る）し、特定の病気にかかりやすいかどうかもマーカーになる部分をピンポイントで読むよね。

[rryu]

化学系は大体直接観測できなくて、こういう物資が含まれていればこういう反応になるはずみたいなのばかりで、そんなので大丈夫なのだろうかと思ったりするのだが、まあ大丈夫なのだろう。

[lyiase]

この方法は次世代シーケンサの原理だね。現状では約10万円ちょいで出来るようになった現実的な解だけど、他にも色々な方法が検討されてるね。

[qtamaki]

それだけ膨大な資金が流れ込んでいるんだなあ

[tmatsuu]

誤解してた。知らないことを知るって楽しい。

[filinion]

…ああ、「DNA読み取り」って、人工的なDNAシーケンサーの話か。細胞内でリボソームがやってる作業の話かと思ったから途中で「？？？」となった。（頭からシーケンシャルに読むわけでない点は双方同じなのでなおさら）

[mobanama]

"その結果は信頼することができない"でもだいたいあってるよ。

[toycan2004]

もう少し楽な手法が見つかると良いのだけど