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パスウェイデータベースBioCycを使ってパスウェイを検索する
BioCyc(バイオサイクと読みます)はSRIインターナショナル(Stanford Research Institute)が開発するパス... BioCyc(バイオサイクと読みます)はSRIインターナショナル(Stanford Research Institute)が開発するパスウェイデータベースです。大腸菌からヒトまで幅広く対象にしており、異株を含めて7600種以上が収載されています。収載されているパスウェイデータは主に、専門家が手作業で作成した文献ベースのデータ、自動ツールを利用して作成されたデータを手作業で修正したデータ、自動ツールで作成されたデータがあります。 今回の動画では、BioCycの基本的な操作方法を解説しながら、パスウェイの検索方法や種間比較の方法などについて説明します。 見どころダイジェスト 00:40 1. BioCycのデータベースの説明 01:46 2. E.coliのデータベースを使ってTCA cycleのパスウェイを検索 02:14 3. パスウェイ検索結果の説明 05:22 4. パスウェイ全体図の
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