スライド 1
スパコン利用者説明会 -ＵＧＥでジョブを投入する ノウハウ- 2012/5/10 この講習の目的 数百・数千のジョブを円滑に実行する方 法を知る 1 Univa Grid Engine(UGE)とは グリッドコンピューティングシステムを 構築するソフトウェア。バッチジョブシ ステムとして機能する Sun Grid Engine6.2U5(オープンソー ス版としては最後のバージョン)から派生 した商用製品。開発にはGrid Engineの 主要な開発メンバーが参加している ジョブ投入時のコマンド等はSGEと同じ 2 ＵＧＥを利用する利点 大量のジョブを逐次、円滑に実行できる 複数のユーザが同時に大量のジョブを投入し ても、UGEがスケジューリングを行う ジョブが求めるメモリ、CPU等に応じて、 適切なスケジューリングを行う 3 ＵＧＥを利用するうえでの注意点 ジ
bbcp
BBCP 15.02.03.00.1 1 BBCP Syntax 1.1 Checksum Considerations (-e and –E) 1.2 Tuning Considerations 1.2.1 Window Size (-w) 1.2.2 Streams (-s) 1.2.3 I/O Buffer Size (-B) 1.2.4 Output Ordering (-o and –b +) 1.2.5 Input Blocking (-b) 1.2.6 Compression (-c) 1.2.7 Un-buffered I/O (-u) 1.2.8 Routing (-z) 1.3 Resuming Failed Copies (
Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions - Nature
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