On the Immortality of Television Sets: “Function” in the Human Genome According to the Evolution-Free Gospel of ENCODE
“Data is not information, information is not knowledge, knowledge is not wisdom, wisdom is not truth,” —Robert Royar (1994) paraphrasing Frank Zappa’s (1979) anadiplosis “I would be quite proud to have served on the committee that designed the E. coli genome. There is, however, no way that I would admit to serving on a committee that designed the human genome. Not even a university committee could
第1回 Jubatus ハンズオンを開催しました
2/18にIIJ様の神保町オフィスにて、第1回Jubatusハンズオンを開催いたしました。 当日の発表資料はこちらです。 第1回 Jubatusハンズオン from JubatusOfficial また、発表内容と同内容のテキストもありますので、こちらもご覧...
Data barriers limit genetic diagnosis - Nature
For the first five months of Harrison Harkins’ life, doctors had little idea about what was causing his spinal malformation and inability to gain weight. But in November 2011, Matthew Bainbridge, a computational biologist at Baylor College of Medicine in Houston, Texas, found a clue. After analysing genetic data from Harrison and his parents, Bainbridge discovered that the child had an abnormal ve
朝日新聞デジタル：受動喫煙でアルツハイマー病悪化の可能性 米研究チーム - テック＆サイエンス
【月舘彩子】受動喫煙で、アルツハイマー病が悪化する可能性のあることが、米テキサス大医学部などのチームによるマウスの実験で明らかになった。１９日付英科学誌ネイチャーコミュニケーションズに掲載された。 認知症の一つであるアルツハイマー病は、脳の中にアミロイドベータ（Ａβ）やタウと呼ばれる異常なたんぱく質が蓄積することで、やがて神経細胞が減り、記憶力や判断力が衰えるとされる。 チームは、遺伝子操作でアルツハイマー病を発病するようにした生後３カ月のマウスを、１日に１時間、たばこ１本分の煙にさらされるグループと、全く煙のない部屋で育てたグループに分けて４カ月間育てた。 すると、煙にさらされたマウスはそうでなかったマウスに比べ、脳内で記憶をつかさどる海馬や大脳皮質の神経細胞にＡβが約４０〜５０％多く蓄積。炎症を起こしている神経も増えていた。チームは「人への影響はさらなる研究が必要だが、たばこの煙
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Cytoscape: An Open Source Platform for Biological Network Analysis and Visualization
Genome-wide Chromatin State Transitions Associated with Developmental and Environmental Cues
Epigenomics road map - Nature Reviews Genetics