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BLASTの利用方法
BLASTの利用方法 永松 秀人, 廣安 知之, 三木 光範 ISDL Report No. 20030608007 2003年 9月 30日 Abs... BLASTの利用方法 永松 秀人, 廣安 知之, 三木 光範 ISDL Report No. 20030608007 2003年 9月 30日 Abstract 本レポートは相同性検索のためのプログラムであるBLASTについての使用方法についてまとめたものである. BLASTを用いた相同性検索を行う場合, 使用するプログラムの選択, 検索対象となるデータベースの選択, および問い合わせ配列の決定を行わなければならない. これらは問い合わせ配列が塩基配列であるか, アミノ酸配列であるかによって大まかに決定される. 実行結果にはスコア, E-Value, 同一残基率が示され, これらの値が類似性の指標となる. また, 詳しいアラインメントの様子なども同時に出力される. 1 はじめに 相同性検索とは, 問い合わせ配列を配列データベースと比較し, 類似配列を探すことである. 相同性検索