ChinaXiv.org 中国科学院科技论文预发布平台 | Decoding the evolution and transmissions of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) using whole genomic data

摘要: Background. The outbreak of COVID-19 started in mid-December 2019 in Wuhan, Central China. Up to February 18, 2020, SARS-CoV-2 has infected more than 70,000 people in China, and another 25 countries across five continents. In this study, we used 93 complete genomes of SARS-CoV-2 from the GISAID EpiFluTM database to decode the evolution and human-to-human transmissions of SARS-CoV-2 in the rece

[barringtonia]

コロナウイルス系統論文。読み辛いが多分、武漢の主流ハプロタイプが祖先型でないことから、最初の感染は武漢の外で起こったと推論。中国の友人によると著者らはメディアが内容を誤解していると憤慨しているらしい。

[haruhiwai18]

"Phyloepidemiologic analyses indicated the SARS-CoV-2 source at the Hua Nan market should be imported from other places. "　→ウィルスは、武漢の市場の外（ほかの場所）から来た、という風に書かれている。どこなのかは書いていない。

[dltlt]

武漢の海鮮市場、持ち込まれた側なのか。著者のいうとおり、始祖は深圳のH13なのだろうか？ H3の中国での「ハブ」がないことが気になる。12月初旬までの患者の検体が分析できれば、H3が始祖ということもあり得る……？

[avictor]

NHKの記事のはこれか。

[kumicit]

Yu, Wen-Bin et al. suggest that "SARS-CoV-2 may have already circulated widely among humans in Wuhan before December 2019, probably beginning in mid to late November"

[mmsuzuki]

海鮮市場が発生源ではない？