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2020 5/28 追記、10/5 タイトル修正、12/24 linuxでのインストール追記 2021 1/13 誤字修正 2024/02/21 ... 2020 5/28 追記、10/5 タイトル修正、12/24 linuxでのインストール追記 2021 1/13 誤字修正 2024/02/21 追記,2/25追記 GenBank のような公開データベースに登録されているゲノムの数が増え続けていることから、種の遺伝子レパートリーを比較するためのツールが開発されている。このような比較には、種分化イベントの後に共通の祖先から発散したと仮定され、パラログよりも生物間で機能が保存されている可能性が高いオルソログ遺伝子の同定が含まれる(ref.1)。このため、オルソログはゲノムアノテーションや進化研究の重要な要素となっている(ref.2,3)。生命の他のどの領域よりも高速に配列決定されている細菌間では(ref.4)、直交配列を検出するための一般的なヒューリスティックな方法は、単にBLASTの相互ヒットを探すことであり(ref.5, 6)、このタスク
2020/06/01 リンク