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napariでPointを配置した輝点を2次元ガウシアンでフィッティングする - Qiita
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napariでPointを配置した輝点を2次元ガウシアンでフィッティングする - Qiita
やりたいこと 輝点画像にPointを配置して、その輝点を2次元ガウシアンでフィッティングして、輝点の座... やりたいこと 輝点画像にPointを配置して、その輝点を2次元ガウシアンでフィッティングして、輝点の座標を出力したい。 コード import glob import math import napari import numpy as np from scipy.optimize import curve_fit from skimage import io dir_name = "./data" file_names = glob.glob(dir_name + "/*.tif") stack = np.array([io.imread(file_name) for file_name in file_names]) viewer = napari.view_image(stack) points_layer = viewer.add_points(ndim=3) ws = 9 def