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GRCh37とHg19
突然ですがヒトのゲノムにマッピングをするとき、NCBIの配列を使いますか? それともUCSCの配列を使い... 突然ですがヒトのゲノムにマッピングをするとき、NCBIの配列を使いますか? それともUCSCの配列を使いますか? GRCh37 (Genome Reference Consortium human build 37) ? Hg19 (UCSC human genome 19) ? リファレンス配列、1番から22番+X、Y染色体に関して言えば、配列はどちらも同じです。 そう言われても信じない方もいると思うし、現にヒューマンエラーで多少違うんでは?と思っている方もいるでしょう。 どちらも全く同じ配列だ、ということはUCSCのゲノムブラウザなどで、GRCh37/hg19 と記述されていることから何となく信じている方がほとんどだと思います。 でも、たまにお客さんから、どっちがいいの? 本当に同じ配列なの? と聞かれることもありました。 そういう疑問を持つ方もいるらしく、私はとりあえず、A、T、C、
2011/12/20 リンク