UCSC Gene Sorterを使って遺伝子間の関連性を検索する 2017

UCSC Gene Sorterは、 米国カリフォルニア大学サンタクルーズ校(UCSC)が開発、維持しているUCSC Genome Browser の中のコンテンツの一つです。UCSC Gene Sorterは、興味のある遺伝子周辺もしくは遺伝子同士の関連性について、UCSC Genome Browserが持つさまざまなデータを使って文字通り「ソート」することによって容易に検索することができるツールです。最近のアップデートで、GTExプロジェクトで測定された正常組織の発現プロファイルデータを利用できるようになっており利便性が向上しています。関連性のある遺伝子をリストアップした後、それらの遺伝子に関するIDや配列をまとめて取得することができます。今回は、心筋で特異的に発現する遺伝子TNNT2(Troponin T2, cardiac type)を例にして使い方を説明しています。 ちなみに、U

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“UCSC Gene Sorterは、興味のある遺伝子周辺もしくは遺伝子同士の関連性について、文字通り「ソート」することによって容易に検索することができるツール。最近のアップデートで、GTExの発現プロファイルが” #togotv