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Kaggle: MoA Prediction コンペティションの上位解法と私の解法 - Qiita
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Kaggle: MoA Prediction コンペティションの上位解法と私の解法 - Qiita
2020年9月4日から約3ヶ月にわたってMechanisms of Action (MoA) PredictionというコンペティションがKag... 2020年9月4日から約3ヶ月にわたってMechanisms of Action (MoA) PredictionというコンペティションがKaggleで開催されました。この記事では、このコンペの上位解法と私の解法の要点を紹介します。 なお、この記事は創薬 (dry) Advent Calendar 2020の16日目の記事です。 コンペの概要 一言でいうと、薬剤で処理した (1)ある細胞の772種類の遺伝子発現データと (2)100種類の細胞の生存率のデータを主な特徴量として、作用機序(MoA)を予測するという問題設定でした。このコンペを通じて開発された予測モデルを適用することで、作用機序が不明な薬剤の作用機序を推定することができますし、場合によっては既知の薬剤の未知の作用を発見すること (drug repositioning/re-purposing) への応用も期待できると思います。